Protein–RNA interactions for Protein: Q5SXY1

Specc1, Cytospin-B, mousemouse

Predictions only

Length 1,067 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Specc1Q5SXY1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Specc1Q5SXY1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Specc1Q5SXY1 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Specc1Q5SXY1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Specc1Q5SXY1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Specc1Q5SXY1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Specc1Q5SXY1 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC30.62■■■□□ 2.49
Specc1Q5SXY1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Specc1Q5SXY1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Specc1Q5SXY1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.52■■■□□ 2.48
Specc1Q5SXY1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Specc1Q5SXY1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC30.51■■■□□ 2.47
Specc1Q5SXY1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Specc1Q5SXY1 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Specc1Q5SXY1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Specc1Q5SXY1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC30.46■■■□□ 2.47
Specc1Q5SXY1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Specc1Q5SXY1 Samd1-201ENSMUST00000095228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Specc1Q5SXY1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Specc1Q5SXY1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Specc1Q5SXY1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Specc1Q5SXY1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Specc1Q5SXY1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Specc1Q5SXY1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Specc1Q5SXY1 Fbxo6-203ENSMUST00000105706 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Specc1Q5SXY1 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Specc1Q5SXY1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Specc1Q5SXY1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Specc1Q5SXY1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Specc1Q5SXY1 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.4■■■□□ 2.46
Specc1Q5SXY1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Specc1Q5SXY1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Specc1Q5SXY1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC30.38■■■□□ 2.45
Specc1Q5SXY1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Specc1Q5SXY1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.36■■■□□ 2.45
Specc1Q5SXY1 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC30.35■■■□□ 2.45
Specc1Q5SXY1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Specc1Q5SXY1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.33■■■□□ 2.45
Specc1Q5SXY1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30.31■■■□□ 2.44
Specc1Q5SXY1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Specc1Q5SXY1 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC30.3■■■□□ 2.44
Specc1Q5SXY1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC30.28■■■□□ 2.44
Specc1Q5SXY1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.28■■■□□ 2.44
Specc1Q5SXY1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Specc1Q5SXY1 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Specc1Q5SXY1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Specc1Q5SXY1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Specc1Q5SXY1 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Specc1Q5SXY1 Glt8d1-201ENSMUST00000022476 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.24■■■□□ 2.43
Specc1Q5SXY1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Specc1Q5SXY1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC30.23■■■□□ 2.43
Specc1Q5SXY1 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Specc1Q5SXY1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Specc1Q5SXY1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC30.21■■■□□ 2.43
Specc1Q5SXY1 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Specc1Q5SXY1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC30.19■■■□□ 2.42
Specc1Q5SXY1 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Specc1Q5SXY1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Specc1Q5SXY1 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC30.13■■■□□ 2.41
Specc1Q5SXY1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30.12■■■□□ 2.41
Specc1Q5SXY1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Specc1Q5SXY1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC30.07■■■□□ 2.4
Specc1Q5SXY1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Specc1Q5SXY1 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Specc1Q5SXY1 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Specc1Q5SXY1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC30.06■■■□□ 2.4
Specc1Q5SXY1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.05■■■□□ 2.4
Specc1Q5SXY1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC30.05■■■□□ 2.4
Specc1Q5SXY1 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.03■■■□□ 2.4
Specc1Q5SXY1 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC30.03■■■□□ 2.4
Specc1Q5SXY1 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC30.02■■■□□ 2.4
Specc1Q5SXY1 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.97■■■□□ 2.39
Specc1Q5SXY1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
Specc1Q5SXY1 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC29.93■■■□□ 2.38
Specc1Q5SXY1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
Specc1Q5SXY1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC29.9■■■□□ 2.38
Specc1Q5SXY1 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.89■■■□□ 2.38
Specc1Q5SXY1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
Specc1Q5SXY1 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
Specc1Q5SXY1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Specc1Q5SXY1 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
Specc1Q5SXY1 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
Specc1Q5SXY1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
Specc1Q5SXY1 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC29.86■■■□□ 2.37
Specc1Q5SXY1 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC29.85■■■□□ 2.37
Specc1Q5SXY1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
Specc1Q5SXY1 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
Specc1Q5SXY1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
Specc1Q5SXY1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
Specc1Q5SXY1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
Specc1Q5SXY1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
Specc1Q5SXY1 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
Specc1Q5SXY1 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.34
Specc1Q5SXY1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
Specc1Q5SXY1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Specc1Q5SXY1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC29.65■■■□□ 2.34
Specc1Q5SXY1 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
Specc1Q5SXY1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.63■■■□□ 2.33
Specc1Q5SXY1 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
Specc1Q5SXY1 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms