Protein–RNA interactions for Protein: Q5SUE3

Ccdc92b, Coiled-coil domain-containing 92B, mousemouse

Predictions only

Length 299 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc92bQ5SUE3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc92bQ5SUE3 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc92bQ5SUE3 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Ccdc92bQ5SUE3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc92bQ5SUE3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Ccdc92bQ5SUE3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc92bQ5SUE3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Ccdc92bQ5SUE3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc92bQ5SUE3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Ccdc92bQ5SUE3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc92bQ5SUE3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Ccdc92bQ5SUE3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc92bQ5SUE3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Ccdc92bQ5SUE3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc92bQ5SUE3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc92bQ5SUE3 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Ccdc92bQ5SUE3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Ccdc92bQ5SUE3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Ccdc92bQ5SUE3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc92bQ5SUE3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc92bQ5SUE3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Ccdc92bQ5SUE3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
Ccdc92bQ5SUE3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc92bQ5SUE3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Ccdc92bQ5SUE3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Ccdc92bQ5SUE3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc92bQ5SUE3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc92bQ5SUE3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
Ccdc92bQ5SUE3 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Ccdc92bQ5SUE3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc92bQ5SUE3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
Ccdc92bQ5SUE3 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc92bQ5SUE3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.63■■□□□ 1.85
Ccdc92bQ5SUE3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc92bQ5SUE3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc92bQ5SUE3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc92bQ5SUE3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Ccdc92bQ5SUE3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc92bQ5SUE3 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Ccdc92bQ5SUE3 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Ccdc92bQ5SUE3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Ccdc92bQ5SUE3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Ccdc92bQ5SUE3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc92bQ5SUE3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ccdc92bQ5SUE3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc92bQ5SUE3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ccdc92bQ5SUE3 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc92bQ5SUE3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc92bQ5SUE3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc92bQ5SUE3 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc92bQ5SUE3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Ccdc92bQ5SUE3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc92bQ5SUE3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc92bQ5SUE3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ccdc92bQ5SUE3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ccdc92bQ5SUE3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ccdc92bQ5SUE3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc92bQ5SUE3 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ccdc92bQ5SUE3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc92bQ5SUE3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc92bQ5SUE3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ccdc92bQ5SUE3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc92bQ5SUE3 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ccdc92bQ5SUE3 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc92bQ5SUE3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ccdc92bQ5SUE3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc92bQ5SUE3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ccdc92bQ5SUE3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc92bQ5SUE3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ccdc92bQ5SUE3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ccdc92bQ5SUE3 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc92bQ5SUE3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc92bQ5SUE3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ccdc92bQ5SUE3 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc92bQ5SUE3 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc92bQ5SUE3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc92bQ5SUE3 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc92bQ5SUE3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc92bQ5SUE3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc92bQ5SUE3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc92bQ5SUE3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc92bQ5SUE3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc92bQ5SUE3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc92bQ5SUE3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc92bQ5SUE3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc92bQ5SUE3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc92bQ5SUE3 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc92bQ5SUE3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc92bQ5SUE3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc92bQ5SUE3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc92bQ5SUE3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc92bQ5SUE3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc92bQ5SUE3 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ccdc92bQ5SUE3 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ccdc92bQ5SUE3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc92bQ5SUE3 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ccdc92bQ5SUE3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Ccdc92bQ5SUE3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc92bQ5SUE3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Ccdc92bQ5SUE3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.5 ms