Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSN7

Sft2d1, Vesicle transport protein SFT2A, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d1Q5SSN7 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Sft2d1Q5SSN7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sft2d1Q5SSN7 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Sft2d1Q5SSN7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sft2d1Q5SSN7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sft2d1Q5SSN7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sft2d1Q5SSN7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sft2d1Q5SSN7 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sft2d1Q5SSN7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sft2d1Q5SSN7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sft2d1Q5SSN7 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sft2d1Q5SSN7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sft2d1Q5SSN7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sft2d1Q5SSN7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sft2d1Q5SSN7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sft2d1Q5SSN7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sft2d1Q5SSN7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sft2d1Q5SSN7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sft2d1Q5SSN7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sft2d1Q5SSN7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sft2d1Q5SSN7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sft2d1Q5SSN7 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sft2d1Q5SSN7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Sft2d1Q5SSN7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sft2d1Q5SSN7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Sft2d1Q5SSN7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sft2d1Q5SSN7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Sft2d1Q5SSN7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
Sft2d1Q5SSN7 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sft2d1Q5SSN7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Sft2d1Q5SSN7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Sft2d1Q5SSN7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Sft2d1Q5SSN7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sft2d1Q5SSN7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sft2d1Q5SSN7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Sft2d1Q5SSN7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Sft2d1Q5SSN7 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sft2d1Q5SSN7 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Sft2d1Q5SSN7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Sft2d1Q5SSN7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sft2d1Q5SSN7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Sft2d1Q5SSN7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sft2d1Q5SSN7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Sft2d1Q5SSN7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sft2d1Q5SSN7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Sft2d1Q5SSN7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sft2d1Q5SSN7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sft2d1Q5SSN7 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Sft2d1Q5SSN7 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sft2d1Q5SSN7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sft2d1Q5SSN7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Sft2d1Q5SSN7 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sft2d1Q5SSN7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Sft2d1Q5SSN7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sft2d1Q5SSN7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Sft2d1Q5SSN7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sft2d1Q5SSN7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Sft2d1Q5SSN7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Sft2d1Q5SSN7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sft2d1Q5SSN7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sft2d1Q5SSN7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Sft2d1Q5SSN7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Sft2d1Q5SSN7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sft2d1Q5SSN7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Sft2d1Q5SSN7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC20.68■□□□□ 0.9
Sft2d1Q5SSN7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Sft2d1Q5SSN7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sft2d1Q5SSN7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Sft2d1Q5SSN7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Sft2d1Q5SSN7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Sft2d1Q5SSN7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sft2d1Q5SSN7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Sft2d1Q5SSN7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sft2d1Q5SSN7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Sft2d1Q5SSN7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Sft2d1Q5SSN7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Sft2d1Q5SSN7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sft2d1Q5SSN7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sft2d1Q5SSN7 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Sft2d1Q5SSN7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sft2d1Q5SSN7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Sft2d1Q5SSN7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sft2d1Q5SSN7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sft2d1Q5SSN7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Sft2d1Q5SSN7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Sft2d1Q5SSN7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sft2d1Q5SSN7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sft2d1Q5SSN7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Sft2d1Q5SSN7 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Sft2d1Q5SSN7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sft2d1Q5SSN7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Sft2d1Q5SSN7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sft2d1Q5SSN7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sft2d1Q5SSN7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Sft2d1Q5SSN7 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sft2d1Q5SSN7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Sft2d1Q5SSN7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.8 ms