Protein–RNA interactions for Protein: Q5SSM3

Arhgap44, Rho GTPase-activating protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 814 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap44Q5SSM3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Arhgap44Q5SSM3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Arhgap44Q5SSM3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Arhgap44Q5SSM3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Arhgap44Q5SSM3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Arhgap44Q5SSM3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Arhgap44Q5SSM3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Arhgap44Q5SSM3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Arhgap44Q5SSM3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Arhgap44Q5SSM3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Arhgap44Q5SSM3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Arhgap44Q5SSM3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Arhgap44Q5SSM3 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Arhgap44Q5SSM3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Arhgap44Q5SSM3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Arhgap44Q5SSM3 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Arhgap44Q5SSM3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Arhgap44Q5SSM3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Arhgap44Q5SSM3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Arhgap44Q5SSM3 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
Arhgap44Q5SSM3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Arhgap44Q5SSM3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
Arhgap44Q5SSM3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Arhgap44Q5SSM3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Arhgap44Q5SSM3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Arhgap44Q5SSM3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Arhgap44Q5SSM3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Arhgap44Q5SSM3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Arhgap44Q5SSM3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Arhgap44Q5SSM3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Arhgap44Q5SSM3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Arhgap44Q5SSM3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Arhgap44Q5SSM3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Arhgap44Q5SSM3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Arhgap44Q5SSM3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Arhgap44Q5SSM3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Arhgap44Q5SSM3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Arhgap44Q5SSM3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Arhgap44Q5SSM3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Arhgap44Q5SSM3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Arhgap44Q5SSM3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Arhgap44Q5SSM3 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Arhgap44Q5SSM3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Arhgap44Q5SSM3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Arhgap44Q5SSM3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC26.14■■□□□ 1.78
Arhgap44Q5SSM3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Arhgap44Q5SSM3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Arhgap44Q5SSM3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Arhgap44Q5SSM3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Arhgap44Q5SSM3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Arhgap44Q5SSM3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Arhgap44Q5SSM3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Arhgap44Q5SSM3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Arhgap44Q5SSM3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Arhgap44Q5SSM3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Arhgap44Q5SSM3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Arhgap44Q5SSM3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Arhgap44Q5SSM3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Arhgap44Q5SSM3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Arhgap44Q5SSM3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Arhgap44Q5SSM3 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Arhgap44Q5SSM3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Arhgap44Q5SSM3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Arhgap44Q5SSM3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Arhgap44Q5SSM3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Arhgap44Q5SSM3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Arhgap44Q5SSM3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Arhgap44Q5SSM3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Arhgap44Q5SSM3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Arhgap44Q5SSM3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Arhgap44Q5SSM3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Arhgap44Q5SSM3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
Arhgap44Q5SSM3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Arhgap44Q5SSM3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Arhgap44Q5SSM3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Arhgap44Q5SSM3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Arhgap44Q5SSM3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Arhgap44Q5SSM3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Arhgap44Q5SSM3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Arhgap44Q5SSM3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC25.89■■□□□ 1.74
Arhgap44Q5SSM3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Arhgap44Q5SSM3 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Arhgap44Q5SSM3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Arhgap44Q5SSM3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Arhgap44Q5SSM3 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Arhgap44Q5SSM3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Arhgap44Q5SSM3 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Arhgap44Q5SSM3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Arhgap44Q5SSM3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Arhgap44Q5SSM3 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC25.82■■□□□ 1.72
Arhgap44Q5SSM3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Arhgap44Q5SSM3 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Arhgap44Q5SSM3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Arhgap44Q5SSM3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Arhgap44Q5SSM3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Arhgap44Q5SSM3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Arhgap44Q5SSM3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Arhgap44Q5SSM3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Arhgap44Q5SSM3 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Arhgap44Q5SSM3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.7■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms