Protein–RNA interactions for Protein: Q5R1A4

Trdv2-2, T cell receptor delta variable 2-2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 116 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trdv2-2Q5R1A4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trdv2-2Q5R1A4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Trdv2-2Q5R1A4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.65■□□□□ 0.74
Trdv2-2Q5R1A4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.64■□□□□ 0.73
Trdv2-2Q5R1A4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Trdv2-2Q5R1A4 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Trdv2-2Q5R1A4 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trdv2-2Q5R1A4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Trdv2-2Q5R1A4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Trdv2-2Q5R1A4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trdv2-2Q5R1A4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Trdv2-2Q5R1A4 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Trdv2-2Q5R1A4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trdv2-2Q5R1A4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trdv2-2Q5R1A4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Trdv2-2Q5R1A4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Trdv2-2Q5R1A4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trdv2-2Q5R1A4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
Trdv2-2Q5R1A4 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Trdv2-2Q5R1A4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Trdv2-2Q5R1A4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trdv2-2Q5R1A4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Trdv2-2Q5R1A4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trdv2-2Q5R1A4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trdv2-2Q5R1A4 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trdv2-2Q5R1A4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Trdv2-2Q5R1A4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trdv2-2Q5R1A4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trdv2-2Q5R1A4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trdv2-2Q5R1A4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trdv2-2Q5R1A4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trdv2-2Q5R1A4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trdv2-2Q5R1A4 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trdv2-2Q5R1A4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trdv2-2Q5R1A4 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trdv2-2Q5R1A4 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trdv2-2Q5R1A4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trdv2-2Q5R1A4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trdv2-2Q5R1A4 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Trdv2-2Q5R1A4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trdv2-2Q5R1A4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trdv2-2Q5R1A4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
Trdv2-2Q5R1A4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trdv2-2Q5R1A4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Trdv2-2Q5R1A4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trdv2-2Q5R1A4 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Trdv2-2Q5R1A4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Trdv2-2Q5R1A4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trdv2-2Q5R1A4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Trdv2-2Q5R1A4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trdv2-2Q5R1A4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Trdv2-2Q5R1A4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trdv2-2Q5R1A4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trdv2-2Q5R1A4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trdv2-2Q5R1A4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Trdv2-2Q5R1A4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trdv2-2Q5R1A4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trdv2-2Q5R1A4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Trdv2-2Q5R1A4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Trdv2-2Q5R1A4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trdv2-2Q5R1A4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
Trdv2-2Q5R1A4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trdv2-2Q5R1A4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Trdv2-2Q5R1A4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Trdv2-2Q5R1A4 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trdv2-2Q5R1A4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trdv2-2Q5R1A4 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trdv2-2Q5R1A4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Trdv2-2Q5R1A4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trdv2-2Q5R1A4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trdv2-2Q5R1A4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Trdv2-2Q5R1A4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Trdv2-2Q5R1A4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC19.28■□□□□ 0.68
Trdv2-2Q5R1A4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trdv2-2Q5R1A4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Trdv2-2Q5R1A4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Trdv2-2Q5R1A4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trdv2-2Q5R1A4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trdv2-2Q5R1A4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Trdv2-2Q5R1A4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trdv2-2Q5R1A4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trdv2-2Q5R1A4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Trdv2-2Q5R1A4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Trdv2-2Q5R1A4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trdv2-2Q5R1A4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trdv2-2Q5R1A4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Trdv2-2Q5R1A4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Trdv2-2Q5R1A4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trdv2-2Q5R1A4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Trdv2-2Q5R1A4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trdv2-2Q5R1A4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Trdv2-2Q5R1A4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Trdv2-2Q5R1A4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
Trdv2-2Q5R1A4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trdv2-2Q5R1A4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trdv2-2Q5R1A4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trdv2-2Q5R1A4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trdv2-2Q5R1A4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Trdv2-2Q5R1A4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms