Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCY0

Kdm6b, Lysine-specific demethylase 6B, mousemouse

Predictions only

Length 1,641 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6bQ5NCY0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC41■■■■■ 4.15
Kdm6bQ5NCY0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC40.98■■■■■ 4.15
Kdm6bQ5NCY0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
Kdm6bQ5NCY0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.95■■■■■ 4.15
Kdm6bQ5NCY0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.94■■■■■ 4.14
Kdm6bQ5NCY0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.93■■■■■ 4.14
Kdm6bQ5NCY0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.92■■■■■ 4.14
Kdm6bQ5NCY0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC40.91■■■■■ 4.14
Kdm6bQ5NCY0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC40.86■■■■■ 4.13
Kdm6bQ5NCY0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC40.84■■■■■ 4.13
Kdm6bQ5NCY0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.84■■■■■ 4.13
Kdm6bQ5NCY0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.83■■■■■ 4.13
Kdm6bQ5NCY0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC40.73■■■■■ 4.11
Kdm6bQ5NCY0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.72■■■■■ 4.11
Kdm6bQ5NCY0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.71■■■■■ 4.11
Kdm6bQ5NCY0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.71■■■■■ 4.11
Kdm6bQ5NCY0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC40.7■■■■■ 4.11
Kdm6bQ5NCY0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Kdm6bQ5NCY0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.65■■■■■ 4.1
Kdm6bQ5NCY0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC40.63■■■■■ 4.09
Kdm6bQ5NCY0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC40.63■■■■■ 4.09
Kdm6bQ5NCY0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC40.62■■■■■ 4.09
Kdm6bQ5NCY0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC40.62■■■■■ 4.09
Kdm6bQ5NCY0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC40.6■■■■■ 4.09
Kdm6bQ5NCY0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.6■■■■■ 4.09
Kdm6bQ5NCY0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.56■■■■■ 4.08
Kdm6bQ5NCY0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC40.55■■■■■ 4.08
Kdm6bQ5NCY0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC40.53■■■■■ 4.08
Kdm6bQ5NCY0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC40.52■■■■■ 4.08
Kdm6bQ5NCY0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
Kdm6bQ5NCY0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC40.52■■■■■ 4.08
Kdm6bQ5NCY0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.08
Kdm6bQ5NCY0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.51■■■■■ 4.07
Kdm6bQ5NCY0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC40.5■■■■■ 4.07
Kdm6bQ5NCY0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Kdm6bQ5NCY0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC40.47■■■■■ 4.07
Kdm6bQ5NCY0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.45■■■■■ 4.07
Kdm6bQ5NCY0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC40.41■■■■■ 4.06
Kdm6bQ5NCY0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC40.38■■■■■ 4.06
Kdm6bQ5NCY0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Kdm6bQ5NCY0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.37■■■■■ 4.05
Kdm6bQ5NCY0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC40.36■■■■■ 4.05
Kdm6bQ5NCY0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC40.36■■■■■ 4.05
Kdm6bQ5NCY0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC40.32■■■■■ 4.05
Kdm6bQ5NCY0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC40.31■■■■■ 4.04
Kdm6bQ5NCY0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC40.31■■■■■ 4.04
Kdm6bQ5NCY0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.31■■■■■ 4.04
Kdm6bQ5NCY0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC40.31■■■■■ 4.04
Kdm6bQ5NCY0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC40.28■■■■■ 4.04
Kdm6bQ5NCY0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Kdm6bQ5NCY0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC40.28■■■■■ 4.04
Kdm6bQ5NCY0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC40.27■■■■■ 4.04
Kdm6bQ5NCY0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.24■■■■■ 4.03
Kdm6bQ5NCY0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC40.21■■■■■ 4.03
Kdm6bQ5NCY0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Kdm6bQ5NCY0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC40.2■■■■■ 4.03
Kdm6bQ5NCY0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.19■■■■■ 4.02
Kdm6bQ5NCY0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.18■■■■■ 4.02
Kdm6bQ5NCY0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC40.16■■■■■ 4.02
Kdm6bQ5NCY0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.11■■■■■ 4.01
Kdm6bQ5NCY0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC40.1■■■■■ 4.01
Kdm6bQ5NCY0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Kdm6bQ5NCY0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC40.06■■■■■ 4
Kdm6bQ5NCY0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC40.05■■■■■ 4
Kdm6bQ5NCY0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC40.04■■■■■ 4
Kdm6bQ5NCY0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC40.04■■■■■ 4
Kdm6bQ5NCY0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC40.02■■■■■ 4
Kdm6bQ5NCY0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC40.02■■■■■ 4
Kdm6bQ5NCY0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC40.02■■■■■ 4
Kdm6bQ5NCY0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Kdm6bQ5NCY0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC39.99■■■■□ 3.99
Kdm6bQ5NCY0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.99■■■■□ 3.99
Kdm6bQ5NCY0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC39.98■■■■□ 3.99
Kdm6bQ5NCY0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC39.94■■■■□ 3.98
Kdm6bQ5NCY0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC39.9■■■■□ 3.98
Kdm6bQ5NCY0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC39.89■■■■□ 3.98
Kdm6bQ5NCY0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC39.88■■■■□ 3.97
Kdm6bQ5NCY0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC39.87■■■■□ 3.97
Kdm6bQ5NCY0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.86■■■■□ 3.97
Kdm6bQ5NCY0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.82■■■■□ 3.97
Kdm6bQ5NCY0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC39.78■■■■□ 3.96
Kdm6bQ5NCY0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.75■■■■□ 3.95
Kdm6bQ5NCY0 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.74■■■■□ 3.95
Kdm6bQ5NCY0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC39.73■■■■□ 3.95
Kdm6bQ5NCY0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Kdm6bQ5NCY0 Ldb1-208ENSMUST00000185355 2088 ntTSL 1 (best) BASIC39.72■■■■□ 3.95
Kdm6bQ5NCY0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.71■■■■□ 3.95
Kdm6bQ5NCY0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.69■■■■□ 3.94
Kdm6bQ5NCY0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.68■■■■□ 3.94
Kdm6bQ5NCY0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC39.63■■■■□ 3.93
Kdm6bQ5NCY0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC39.62■■■■□ 3.93
Kdm6bQ5NCY0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC39.61■■■■□ 3.93
Kdm6bQ5NCY0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.61■■■■□ 3.93
Kdm6bQ5NCY0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC39.59■■■■□ 3.93
Kdm6bQ5NCY0 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC39.59■■■■□ 3.93
Kdm6bQ5NCY0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.57■■■■□ 3.93
Kdm6bQ5NCY0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC39.56■■■■□ 3.92
Kdm6bQ5NCY0 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC39.55■■■■□ 3.92
Kdm6bQ5NCY0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC39.5■■■■□ 3.91
Kdm6bQ5NCY0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC39.47■■■■□ 3.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms