Protein–RNA interactions for Protein: Q5MJS3

Fam20c, Extracellular serine/threonine protein kinase FAM20C, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam20cQ5MJS3 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam20cQ5MJS3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam20cQ5MJS3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam20cQ5MJS3 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam20cQ5MJS3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fam20cQ5MJS3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam20cQ5MJS3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam20cQ5MJS3 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam20cQ5MJS3 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam20cQ5MJS3 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam20cQ5MJS3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Fam20cQ5MJS3 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam20cQ5MJS3 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam20cQ5MJS3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam20cQ5MJS3 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam20cQ5MJS3 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam20cQ5MJS3 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam20cQ5MJS3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam20cQ5MJS3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam20cQ5MJS3 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam20cQ5MJS3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Fam20cQ5MJS3 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam20cQ5MJS3 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam20cQ5MJS3 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam20cQ5MJS3 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam20cQ5MJS3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam20cQ5MJS3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam20cQ5MJS3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam20cQ5MJS3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam20cQ5MJS3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Fam20cQ5MJS3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam20cQ5MJS3 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam20cQ5MJS3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam20cQ5MJS3 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Fam20cQ5MJS3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Fam20cQ5MJS3 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam20cQ5MJS3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Fam20cQ5MJS3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam20cQ5MJS3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Fam20cQ5MJS3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam20cQ5MJS3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam20cQ5MJS3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam20cQ5MJS3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam20cQ5MJS3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Fam20cQ5MJS3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Fam20cQ5MJS3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Fam20cQ5MJS3 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Fam20cQ5MJS3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Fam20cQ5MJS3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Fam20cQ5MJS3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Fam20cQ5MJS3 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Fam20cQ5MJS3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Fam20cQ5MJS3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Fam20cQ5MJS3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Fam20cQ5MJS3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Fam20cQ5MJS3 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam20cQ5MJS3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam20cQ5MJS3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Fam20cQ5MJS3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam20cQ5MJS3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Fam20cQ5MJS3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam20cQ5MJS3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam20cQ5MJS3 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam20cQ5MJS3 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam20cQ5MJS3 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam20cQ5MJS3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Fam20cQ5MJS3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Fam20cQ5MJS3 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam20cQ5MJS3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Fam20cQ5MJS3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam20cQ5MJS3 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Fam20cQ5MJS3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam20cQ5MJS3 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam20cQ5MJS3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
Fam20cQ5MJS3 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam20cQ5MJS3 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Fam20cQ5MJS3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam20cQ5MJS3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam20cQ5MJS3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Fam20cQ5MJS3 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam20cQ5MJS3 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Fam20cQ5MJS3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam20cQ5MJS3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam20cQ5MJS3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam20cQ5MJS3 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Fam20cQ5MJS3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam20cQ5MJS3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Fam20cQ5MJS3 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam20cQ5MJS3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Fam20cQ5MJS3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Fam20cQ5MJS3 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Fam20cQ5MJS3 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam20cQ5MJS3 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Fam20cQ5MJS3 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam20cQ5MJS3 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam20cQ5MJS3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam20cQ5MJS3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Fam20cQ5MJS3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Fam20cQ5MJS3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Fam20cQ5MJS3 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms