Protein–RNA interactions for Protein: Q587J6

L1td1, LINE-1 type transposase domain-containing protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 782 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
L1td1Q587J6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
L1td1Q587J6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
L1td1Q587J6 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC28.51■■■□□ 2.15
L1td1Q587J6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
L1td1Q587J6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
L1td1Q587J6 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
L1td1Q587J6 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
L1td1Q587J6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
L1td1Q587J6 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
L1td1Q587J6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
L1td1Q587J6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
L1td1Q587J6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
L1td1Q587J6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.43■■■□□ 2.14
L1td1Q587J6 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
L1td1Q587J6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
L1td1Q587J6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
L1td1Q587J6 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
L1td1Q587J6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
L1td1Q587J6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
L1td1Q587J6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
L1td1Q587J6 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
L1td1Q587J6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
L1td1Q587J6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
L1td1Q587J6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
L1td1Q587J6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
L1td1Q587J6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
L1td1Q587J6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
L1td1Q587J6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
L1td1Q587J6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
L1td1Q587J6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
L1td1Q587J6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
L1td1Q587J6 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
L1td1Q587J6 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
L1td1Q587J6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
L1td1Q587J6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
L1td1Q587J6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC28.24■■■□□ 2.11
L1td1Q587J6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
L1td1Q587J6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
L1td1Q587J6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
L1td1Q587J6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC28.22■■■□□ 2.11
L1td1Q587J6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
L1td1Q587J6 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
L1td1Q587J6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
L1td1Q587J6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
L1td1Q587J6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
L1td1Q587J6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
L1td1Q587J6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
L1td1Q587J6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
L1td1Q587J6 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
L1td1Q587J6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
L1td1Q587J6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
L1td1Q587J6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
L1td1Q587J6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
L1td1Q587J6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
L1td1Q587J6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
L1td1Q587J6 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
L1td1Q587J6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
L1td1Q587J6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
L1td1Q587J6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
L1td1Q587J6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
L1td1Q587J6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
L1td1Q587J6 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
L1td1Q587J6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
L1td1Q587J6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
L1td1Q587J6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
L1td1Q587J6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
L1td1Q587J6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.01■■■□□ 2.07
L1td1Q587J6 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
L1td1Q587J6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
L1td1Q587J6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
L1td1Q587J6 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
L1td1Q587J6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
L1td1Q587J6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
L1td1Q587J6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
L1td1Q587J6 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
L1td1Q587J6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
L1td1Q587J6 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
L1td1Q587J6 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
L1td1Q587J6 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
L1td1Q587J6 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
L1td1Q587J6 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
L1td1Q587J6 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
L1td1Q587J6 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
L1td1Q587J6 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
L1td1Q587J6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.85■■■□□ 2.05
L1td1Q587J6 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
L1td1Q587J6 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
L1td1Q587J6 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
L1td1Q587J6 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
L1td1Q587J6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
L1td1Q587J6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
L1td1Q587J6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
L1td1Q587J6 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
L1td1Q587J6 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
L1td1Q587J6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
L1td1Q587J6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
L1td1Q587J6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
L1td1Q587J6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
L1td1Q587J6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
L1td1Q587J6 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms