Protein–RNA interactions for Protein: Q571H0

Urb1, Nucleolar pre-ribosomal-associated protein 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 2,274 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb1Q571H0 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Urb1Q571H0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Urb1Q571H0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Urb1Q571H0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Urb1Q571H0 Vsig8-201ENSMUST00000061835 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Urb1Q571H0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Urb1Q571H0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Urb1Q571H0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Urb1Q571H0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Urb1Q571H0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Urb1Q571H0 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Urb1Q571H0 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Urb1Q571H0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Urb1Q571H0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Urb1Q571H0 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Urb1Q571H0 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Urb1Q571H0 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Urb1Q571H0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Urb1Q571H0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Urb1Q571H0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Urb1Q571H0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Urb1Q571H0 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Urb1Q571H0 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Urb1Q571H0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Urb1Q571H0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Urb1Q571H0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Urb1Q571H0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Urb1Q571H0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Urb1Q571H0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Urb1Q571H0 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Urb1Q571H0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Urb1Q571H0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Urb1Q571H0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Urb1Q571H0 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Urb1Q571H0 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Urb1Q571H0 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Urb1Q571H0 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Urb1Q571H0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Urb1Q571H0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Urb1Q571H0 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Urb1Q571H0 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Urb1Q571H0 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Urb1Q571H0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Urb1Q571H0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Urb1Q571H0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Urb1Q571H0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Urb1Q571H0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Urb1Q571H0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Urb1Q571H0 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Urb1Q571H0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Urb1Q571H0 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Urb1Q571H0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Urb1Q571H0 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Urb1Q571H0 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Urb1Q571H0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Urb1Q571H0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Urb1Q571H0 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Urb1Q571H0 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Urb1Q571H0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Urb1Q571H0 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Urb1Q571H0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Urb1Q571H0 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Urb1Q571H0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Urb1Q571H0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Urb1Q571H0 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Urb1Q571H0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Urb1Q571H0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Urb1Q571H0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Urb1Q571H0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Urb1Q571H0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Urb1Q571H0 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Urb1Q571H0 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Urb1Q571H0 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Urb1Q571H0 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Urb1Q571H0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Urb1Q571H0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Urb1Q571H0 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Urb1Q571H0 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.95■■□□□ 1.43
Urb1Q571H0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Urb1Q571H0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Urb1Q571H0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Urb1Q571H0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Urb1Q571H0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Urb1Q571H0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Urb1Q571H0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Urb1Q571H0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Urb1Q571H0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Urb1Q571H0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Urb1Q571H0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Urb1Q571H0 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Urb1Q571H0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Urb1Q571H0 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Urb1Q571H0 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Urb1Q571H0 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Urb1Q571H0 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Urb1Q571H0 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Urb1Q571H0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Urb1Q571H0 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Urb1Q571H0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Urb1Q571H0 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
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