Protein–RNA interactions for Protein: Q52KE7

Ccnl1, Cyclin-L1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccnl1Q52KE7 Pkdcc-204ENSMUST00000170794 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Ccnl1Q52KE7 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.49■■■■□ 3.11
Ccnl1Q52KE7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.47■■■■□ 3.11
Ccnl1Q52KE7 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC34.45■■■■□ 3.11
Ccnl1Q52KE7 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC34.45■■■■□ 3.1
Ccnl1Q52KE7 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Ccnl1Q52KE7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Ccnl1Q52KE7 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC34.4■■■■□ 3.1
Ccnl1Q52KE7 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Ccnl1Q52KE7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.37■■■■□ 3.09
Ccnl1Q52KE7 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC34.33■■■■□ 3.09
Ccnl1Q52KE7 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Ccnl1Q52KE7 Tmem259-201ENSMUST00000052885 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Ccnl1Q52KE7 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC34.32■■■■□ 3.08
Ccnl1Q52KE7 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ccnl1Q52KE7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ccnl1Q52KE7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Ccnl1Q52KE7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC34.29■■■■□ 3.08
Ccnl1Q52KE7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Ccnl1Q52KE7 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ccnl1Q52KE7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Ccnl1Q52KE7 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Ccnl1Q52KE7 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.2■■■■□ 3.06
Ccnl1Q52KE7 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ccnl1Q52KE7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC34.15■■■■□ 3.06
Ccnl1Q52KE7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC34.11■■■■□ 3.05
Ccnl1Q52KE7 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Ccnl1Q52KE7 Rnf215-201ENSMUST00000003677 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.09■■■■□ 3.05
Ccnl1Q52KE7 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Ccnl1Q52KE7 Atp1b3-201ENSMUST00000034983 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.05■■■■□ 3.04
Ccnl1Q52KE7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ccnl1Q52KE7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ccnl1Q52KE7 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC34.04■■■■□ 3.04
Ccnl1Q52KE7 Sept3-202ENSMUST00000116423 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Ccnl1Q52KE7 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ccnl1Q52KE7 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC34.03■■■■□ 3.04
Ccnl1Q52KE7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Ccnl1Q52KE7 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Ccnl1Q52KE7 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.01■■■■□ 3.03
Ccnl1Q52KE7 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.98■■■■□ 3.03
Ccnl1Q52KE7 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.96■■■■□ 3.03
Ccnl1Q52KE7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Ccnl1Q52KE7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.03
Ccnl1Q52KE7 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ccnl1Q52KE7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
Ccnl1Q52KE7 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
Ccnl1Q52KE7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
Ccnl1Q52KE7 Foxd3-201ENSMUST00000087285 2324 ntAPPRIS P1 BASIC33.9■■■■□ 3.02
Ccnl1Q52KE7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
Ccnl1Q52KE7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ccnl1Q52KE7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ccnl1Q52KE7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
Ccnl1Q52KE7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ccnl1Q52KE7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ccnl1Q52KE7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
Ccnl1Q52KE7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
Ccnl1Q52KE7 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ccnl1Q52KE7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ccnl1Q52KE7 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.8■■■■□ 3
Ccnl1Q52KE7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC33.79■■■■□ 3
Ccnl1Q52KE7 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Ccnl1Q52KE7 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC33.78■■■■□ 3
Ccnl1Q52KE7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.72■■■□□ 2.99
Ccnl1Q52KE7 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC33.71■■■□□ 2.99
Ccnl1Q52KE7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC33.7■■■□□ 2.99
Ccnl1Q52KE7 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC33.7■■■□□ 2.99
Ccnl1Q52KE7 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ccnl1Q52KE7 Gm26699-201ENSMUST00000180825 2291 ntTSL 5 BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ccnl1Q52KE7 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.68■■■□□ 2.98
Ccnl1Q52KE7 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
Ccnl1Q52KE7 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
Ccnl1Q52KE7 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
Ccnl1Q52KE7 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ccnl1Q52KE7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ccnl1Q52KE7 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
Ccnl1Q52KE7 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
Ccnl1Q52KE7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC33.6■■■□□ 2.97
Ccnl1Q52KE7 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC33.56■■■□□ 2.96
Ccnl1Q52KE7 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC33.55■■■□□ 2.96
Ccnl1Q52KE7 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ccnl1Q52KE7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.95
Ccnl1Q52KE7 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
Ccnl1Q52KE7 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ccnl1Q52KE7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
Ccnl1Q52KE7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
Ccnl1Q52KE7 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.94
Ccnl1Q52KE7 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.44■■■□□ 2.94
Ccnl1Q52KE7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC33.42■■■□□ 2.94
Ccnl1Q52KE7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ccnl1Q52KE7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.41■■■□□ 2.94
Ccnl1Q52KE7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ccnl1Q52KE7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.4■■■□□ 2.94
Ccnl1Q52KE7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC33.39■■■□□ 2.94
Ccnl1Q52KE7 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC33.39■■■□□ 2.94
Ccnl1Q52KE7 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ccnl1Q52KE7 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC33.38■■■□□ 2.93
Ccnl1Q52KE7 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC33.37■■■□□ 2.93
Ccnl1Q52KE7 Epcam-201ENSMUST00000053577 2040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ccnl1Q52KE7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.36■■■□□ 2.93
Ccnl1Q52KE7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC33.35■■■□□ 2.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.3 ms