Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZGD8

Nxf2, Nuclear RNA export factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 691 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nxf2Q4ZGD8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Nxf2Q4ZGD8 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
Nxf2Q4ZGD8 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Nxf2Q4ZGD8 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Nxf2Q4ZGD8 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nxf2Q4ZGD8 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nxf2Q4ZGD8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Nxf2Q4ZGD8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nxf2Q4ZGD8 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nxf2Q4ZGD8 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Nxf2Q4ZGD8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Nxf2Q4ZGD8 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Nxf2Q4ZGD8 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Nxf2Q4ZGD8 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Nxf2Q4ZGD8 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nxf2Q4ZGD8 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Nxf2Q4ZGD8 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nxf2Q4ZGD8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Nxf2Q4ZGD8 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nxf2Q4ZGD8 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Nxf2Q4ZGD8 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Nxf2Q4ZGD8 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Nxf2Q4ZGD8 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Nxf2Q4ZGD8 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nxf2Q4ZGD8 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nxf2Q4ZGD8 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Nxf2Q4ZGD8 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Nxf2Q4ZGD8 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Nxf2Q4ZGD8 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nxf2Q4ZGD8 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Nxf2Q4ZGD8 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nxf2Q4ZGD8 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Nxf2Q4ZGD8 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Nxf2Q4ZGD8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Nxf2Q4ZGD8 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Nxf2Q4ZGD8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Nxf2Q4ZGD8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nxf2Q4ZGD8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nxf2Q4ZGD8 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Nxf2Q4ZGD8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Nxf2Q4ZGD8 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Nxf2Q4ZGD8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Nxf2Q4ZGD8 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Nxf2Q4ZGD8 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Nxf2Q4ZGD8 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Nxf2Q4ZGD8 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Nxf2Q4ZGD8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nxf2Q4ZGD8 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nxf2Q4ZGD8 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Nxf2Q4ZGD8 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Nxf2Q4ZGD8 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nxf2Q4ZGD8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Nxf2Q4ZGD8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nxf2Q4ZGD8 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nxf2Q4ZGD8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Nxf2Q4ZGD8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Nxf2Q4ZGD8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Nxf2Q4ZGD8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Nxf2Q4ZGD8 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
Nxf2Q4ZGD8 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Nxf2Q4ZGD8 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nxf2Q4ZGD8 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Nxf2Q4ZGD8 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nxf2Q4ZGD8 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
Nxf2Q4ZGD8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nxf2Q4ZGD8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Nxf2Q4ZGD8 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nxf2Q4ZGD8 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Nxf2Q4ZGD8 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nxf2Q4ZGD8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nxf2Q4ZGD8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Nxf2Q4ZGD8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Nxf2Q4ZGD8 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Nxf2Q4ZGD8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
Nxf2Q4ZGD8 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nxf2Q4ZGD8 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nxf2Q4ZGD8 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
Nxf2Q4ZGD8 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nxf2Q4ZGD8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
Nxf2Q4ZGD8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
Nxf2Q4ZGD8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nxf2Q4ZGD8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
Nxf2Q4ZGD8 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
Nxf2Q4ZGD8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nxf2Q4ZGD8 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nxf2Q4ZGD8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nxf2Q4ZGD8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Nxf2Q4ZGD8 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Nxf2Q4ZGD8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
Nxf2Q4ZGD8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nxf2Q4ZGD8 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Nxf2Q4ZGD8 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.05
Nxf2Q4ZGD8 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
Nxf2Q4ZGD8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
Nxf2Q4ZGD8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Nxf2Q4ZGD8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
Nxf2Q4ZGD8 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Nxf2Q4ZGD8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Nxf2Q4ZGD8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
Nxf2Q4ZGD8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.7 ms