Protein–RNA interactions for Protein: Q3ZN08

Fam220a, Protein FAM220A, mousemouse

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Length 260 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam220aQ3ZN08 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Fam220aQ3ZN08 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fam220aQ3ZN08 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Fam220aQ3ZN08 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Fam220aQ3ZN08 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam220aQ3ZN08 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Fam220aQ3ZN08 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam220aQ3ZN08 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Fam220aQ3ZN08 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Fam220aQ3ZN08 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam220aQ3ZN08 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Fam220aQ3ZN08 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Fam220aQ3ZN08 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam220aQ3ZN08 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam220aQ3ZN08 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Fam220aQ3ZN08 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Fam220aQ3ZN08 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
Fam220aQ3ZN08 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Fam220aQ3ZN08 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Fam220aQ3ZN08 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Fam220aQ3ZN08 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam220aQ3ZN08 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam220aQ3ZN08 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fam220aQ3ZN08 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam220aQ3ZN08 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fam220aQ3ZN08 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fam220aQ3ZN08 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fam220aQ3ZN08 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam220aQ3ZN08 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Fam220aQ3ZN08 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fam220aQ3ZN08 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fam220aQ3ZN08 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fam220aQ3ZN08 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fam220aQ3ZN08 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fam220aQ3ZN08 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fam220aQ3ZN08 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Fam220aQ3ZN08 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fam220aQ3ZN08 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam220aQ3ZN08 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam220aQ3ZN08 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fam220aQ3ZN08 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Fam220aQ3ZN08 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Fam220aQ3ZN08 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Fam220aQ3ZN08 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Fam220aQ3ZN08 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
Fam220aQ3ZN08 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam220aQ3ZN08 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Fam220aQ3ZN08 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam220aQ3ZN08 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Fam220aQ3ZN08 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam220aQ3ZN08 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Fam220aQ3ZN08 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam220aQ3ZN08 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Fam220aQ3ZN08 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam220aQ3ZN08 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Fam220aQ3ZN08 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Fam220aQ3ZN08 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Fam220aQ3ZN08 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam220aQ3ZN08 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Fam220aQ3ZN08 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam220aQ3ZN08 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Fam220aQ3ZN08 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Fam220aQ3ZN08 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Fam220aQ3ZN08 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam220aQ3ZN08 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Fam220aQ3ZN08 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam220aQ3ZN08 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Fam220aQ3ZN08 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam220aQ3ZN08 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam220aQ3ZN08 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Fam220aQ3ZN08 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Fam220aQ3ZN08 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam220aQ3ZN08 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam220aQ3ZN08 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam220aQ3ZN08 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Fam220aQ3ZN08 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Fam220aQ3ZN08 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Fam220aQ3ZN08 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam220aQ3ZN08 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam220aQ3ZN08 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam220aQ3ZN08 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Fam220aQ3ZN08 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fam220aQ3ZN08 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Fam220aQ3ZN08 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam220aQ3ZN08 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam220aQ3ZN08 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Fam220aQ3ZN08 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Fam220aQ3ZN08 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam220aQ3ZN08 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam220aQ3ZN08 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Fam220aQ3ZN08 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam220aQ3ZN08 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Fam220aQ3ZN08 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam220aQ3ZN08 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Fam220aQ3ZN08 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam220aQ3ZN08 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam220aQ3ZN08 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam220aQ3ZN08 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Fam220aQ3ZN08 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Fam220aQ3ZN08 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
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