Protein–RNA interactions for Protein: Q3V1N9

A3galt2, Alpha-1,3-galactosyltransferase 2, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
A3galt2Q3V1N9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A3galt2Q3V1N9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
A3galt2Q3V1N9 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
A3galt2Q3V1N9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
A3galt2Q3V1N9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
A3galt2Q3V1N9 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
A3galt2Q3V1N9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
A3galt2Q3V1N9 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
A3galt2Q3V1N9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A3galt2Q3V1N9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
A3galt2Q3V1N9 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A3galt2Q3V1N9 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
A3galt2Q3V1N9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A3galt2Q3V1N9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
A3galt2Q3V1N9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
A3galt2Q3V1N9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A3galt2Q3V1N9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
A3galt2Q3V1N9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A3galt2Q3V1N9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.41■■□□□ 1.02
A3galt2Q3V1N9 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A3galt2Q3V1N9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
A3galt2Q3V1N9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
A3galt2Q3V1N9 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A3galt2Q3V1N9 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A3galt2Q3V1N9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
A3galt2Q3V1N9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
A3galt2Q3V1N9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
A3galt2Q3V1N9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A3galt2Q3V1N9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
A3galt2Q3V1N9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
A3galt2Q3V1N9 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
A3galt2Q3V1N9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A3galt2Q3V1N9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A3galt2Q3V1N9 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
A3galt2Q3V1N9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.3■■□□□ 1
A3galt2Q3V1N9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
A3galt2Q3V1N9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A3galt2Q3V1N9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
A3galt2Q3V1N9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A3galt2Q3V1N9 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A3galt2Q3V1N9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
A3galt2Q3V1N9 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A3galt2Q3V1N9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
A3galt2Q3V1N9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
A3galt2Q3V1N9 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
A3galt2Q3V1N9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
A3galt2Q3V1N9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A3galt2Q3V1N9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
A3galt2Q3V1N9 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
A3galt2Q3V1N9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
A3galt2Q3V1N9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
A3galt2Q3V1N9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
A3galt2Q3V1N9 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
A3galt2Q3V1N9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
A3galt2Q3V1N9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
A3galt2Q3V1N9 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
A3galt2Q3V1N9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A3galt2Q3V1N9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
A3galt2Q3V1N9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
A3galt2Q3V1N9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
A3galt2Q3V1N9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
A3galt2Q3V1N9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
A3galt2Q3V1N9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
A3galt2Q3V1N9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
A3galt2Q3V1N9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A3galt2Q3V1N9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
A3galt2Q3V1N9 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
A3galt2Q3V1N9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
A3galt2Q3V1N9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
A3galt2Q3V1N9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
A3galt2Q3V1N9 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
A3galt2Q3V1N9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
A3galt2Q3V1N9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
A3galt2Q3V1N9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
A3galt2Q3V1N9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
A3galt2Q3V1N9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
A3galt2Q3V1N9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
A3galt2Q3V1N9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
A3galt2Q3V1N9 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
A3galt2Q3V1N9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
A3galt2Q3V1N9 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
A3galt2Q3V1N9 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
A3galt2Q3V1N9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
A3galt2Q3V1N9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
A3galt2Q3V1N9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
A3galt2Q3V1N9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
A3galt2Q3V1N9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
A3galt2Q3V1N9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
A3galt2Q3V1N9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
A3galt2Q3V1N9 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
A3galt2Q3V1N9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
A3galt2Q3V1N9 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
A3galt2Q3V1N9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
A3galt2Q3V1N9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
A3galt2Q3V1N9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
A3galt2Q3V1N9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
A3galt2Q3V1N9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
A3galt2Q3V1N9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
A3galt2Q3V1N9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
A3galt2Q3V1N9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms