Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0H9

4930596D02Rik, RIKEN cDNA 4930596D02 gene, mousemouse

Predictions only

Length 216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930596D02RikQ3V0H9 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
4930596D02RikQ3V0H9 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
4930596D02RikQ3V0H9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
4930596D02RikQ3V0H9 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
4930596D02RikQ3V0H9 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
4930596D02RikQ3V0H9 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
4930596D02RikQ3V0H9 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930596D02RikQ3V0H9 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
4930596D02RikQ3V0H9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
4930596D02RikQ3V0H9 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
4930596D02RikQ3V0H9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.6 ms