Protein–RNA interactions for Protein: Q3V063

4933416C03Rik, MCG64776, mousemouse

Predictions only

Length 378 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933416C03RikQ3V063 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
4933416C03RikQ3V063 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
4933416C03RikQ3V063 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
4933416C03RikQ3V063 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
4933416C03RikQ3V063 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.31■■■□□ 2.6
4933416C03RikQ3V063 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC31.3■■■□□ 2.6
4933416C03RikQ3V063 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
4933416C03RikQ3V063 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
4933416C03RikQ3V063 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
4933416C03RikQ3V063 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
4933416C03RikQ3V063 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
4933416C03RikQ3V063 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.23■■■□□ 2.59
4933416C03RikQ3V063 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC31.23■■■□□ 2.59
4933416C03RikQ3V063 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
4933416C03RikQ3V063 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
4933416C03RikQ3V063 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
4933416C03RikQ3V063 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
4933416C03RikQ3V063 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC31.19■■■□□ 2.58
4933416C03RikQ3V063 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
4933416C03RikQ3V063 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
4933416C03RikQ3V063 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
4933416C03RikQ3V063 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
4933416C03RikQ3V063 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC31.14■■■□□ 2.58
4933416C03RikQ3V063 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.14■■■□□ 2.58
4933416C03RikQ3V063 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.14■■■□□ 2.57
4933416C03RikQ3V063 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.13■■■□□ 2.57
4933416C03RikQ3V063 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC31.13■■■□□ 2.57
4933416C03RikQ3V063 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
4933416C03RikQ3V063 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
4933416C03RikQ3V063 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
4933416C03RikQ3V063 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
4933416C03RikQ3V063 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
4933416C03RikQ3V063 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.12■■■□□ 2.57
4933416C03RikQ3V063 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.11■■■□□ 2.57
4933416C03RikQ3V063 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.11■■■□□ 2.57
4933416C03RikQ3V063 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC31.1■■■□□ 2.57
4933416C03RikQ3V063 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
4933416C03RikQ3V063 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.09■■■□□ 2.57
4933416C03RikQ3V063 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC31.09■■■□□ 2.57
4933416C03RikQ3V063 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.07■■■□□ 2.56
4933416C03RikQ3V063 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
4933416C03RikQ3V063 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
4933416C03RikQ3V063 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC31.06■■■□□ 2.56
4933416C03RikQ3V063 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC31.04■■■□□ 2.56
4933416C03RikQ3V063 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
4933416C03RikQ3V063 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.56
4933416C03RikQ3V063 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
4933416C03RikQ3V063 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
4933416C03RikQ3V063 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31■■■□□ 2.55
4933416C03RikQ3V063 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
4933416C03RikQ3V063 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
4933416C03RikQ3V063 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC30.98■■■□□ 2.55
4933416C03RikQ3V063 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
4933416C03RikQ3V063 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
4933416C03RikQ3V063 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
4933416C03RikQ3V063 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
4933416C03RikQ3V063 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC30.96■■■□□ 2.55
4933416C03RikQ3V063 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC30.95■■■□□ 2.54
4933416C03RikQ3V063 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
4933416C03RikQ3V063 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC30.93■■■□□ 2.54
4933416C03RikQ3V063 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
4933416C03RikQ3V063 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
4933416C03RikQ3V063 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
4933416C03RikQ3V063 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
4933416C03RikQ3V063 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
4933416C03RikQ3V063 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
4933416C03RikQ3V063 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC30.86■■■□□ 2.53
4933416C03RikQ3V063 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
4933416C03RikQ3V063 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
4933416C03RikQ3V063 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
4933416C03RikQ3V063 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.86■■■□□ 2.53
4933416C03RikQ3V063 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
4933416C03RikQ3V063 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.85■■■□□ 2.53
4933416C03RikQ3V063 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
4933416C03RikQ3V063 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.83■■■□□ 2.53
4933416C03RikQ3V063 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
4933416C03RikQ3V063 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.81■■■□□ 2.52
4933416C03RikQ3V063 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
4933416C03RikQ3V063 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC30.79■■■□□ 2.52
4933416C03RikQ3V063 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
4933416C03RikQ3V063 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
4933416C03RikQ3V063 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.52
4933416C03RikQ3V063 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
4933416C03RikQ3V063 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
4933416C03RikQ3V063 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
4933416C03RikQ3V063 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
4933416C03RikQ3V063 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.74■■■□□ 2.51
4933416C03RikQ3V063 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC30.74■■■□□ 2.51
4933416C03RikQ3V063 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
4933416C03RikQ3V063 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
4933416C03RikQ3V063 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
4933416C03RikQ3V063 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
4933416C03RikQ3V063 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
4933416C03RikQ3V063 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC30.69■■■□□ 2.5
4933416C03RikQ3V063 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
4933416C03RikQ3V063 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
4933416C03RikQ3V063 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
4933416C03RikQ3V063 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC30.68■■■□□ 2.5
4933416C03RikQ3V063 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC30.68■■■□□ 2.5
4933416C03RikQ3V063 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms