Protein–RNA interactions for Protein: Q3V061

Trim80, Tripartite motif-containing 80, mousemouse

Predictions only

Length 624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim80Q3V061 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trim80Q3V061 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trim80Q3V061 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trim80Q3V061 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Trim80Q3V061 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC26.39■■□□□ 1.81
Trim80Q3V061 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Trim80Q3V061 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
Trim80Q3V061 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Trim80Q3V061 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim80Q3V061 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim80Q3V061 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Trim80Q3V061 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Trim80Q3V061 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Trim80Q3V061 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trim80Q3V061 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Trim80Q3V061 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Trim80Q3V061 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Trim80Q3V061 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Trim80Q3V061 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Trim80Q3V061 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Trim80Q3V061 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Trim80Q3V061 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Trim80Q3V061 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC26.21■■□□□ 1.79
Trim80Q3V061 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Trim80Q3V061 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Trim80Q3V061 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Trim80Q3V061 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Trim80Q3V061 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trim80Q3V061 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Trim80Q3V061 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Trim80Q3V061 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Trim80Q3V061 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Trim80Q3V061 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Trim80Q3V061 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim80Q3V061 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Trim80Q3V061 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim80Q3V061 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim80Q3V061 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Trim80Q3V061 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim80Q3V061 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Trim80Q3V061 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Trim80Q3V061 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Trim80Q3V061 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim80Q3V061 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Trim80Q3V061 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim80Q3V061 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Trim80Q3V061 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim80Q3V061 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim80Q3V061 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Trim80Q3V061 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Trim80Q3V061 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Trim80Q3V061 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC26■■□□□ 1.75
Trim80Q3V061 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim80Q3V061 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Trim80Q3V061 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Trim80Q3V061 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim80Q3V061 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Trim80Q3V061 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Trim80Q3V061 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim80Q3V061 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Trim80Q3V061 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim80Q3V061 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Trim80Q3V061 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Trim80Q3V061 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Trim80Q3V061 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim80Q3V061 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Trim80Q3V061 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Trim80Q3V061 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Trim80Q3V061 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim80Q3V061 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Trim80Q3V061 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Trim80Q3V061 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim80Q3V061 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Trim80Q3V061 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Trim80Q3V061 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim80Q3V061 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Trim80Q3V061 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim80Q3V061 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim80Q3V061 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Trim80Q3V061 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim80Q3V061 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Trim80Q3V061 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Trim80Q3V061 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim80Q3V061 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Trim80Q3V061 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Trim80Q3V061 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim80Q3V061 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Trim80Q3V061 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim80Q3V061 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim80Q3V061 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim80Q3V061 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Trim80Q3V061 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Trim80Q3V061 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim80Q3V061 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim80Q3V061 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim80Q3V061 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Trim80Q3V061 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim80Q3V061 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Trim80Q3V061 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Trim80Q3V061 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms