Protein–RNA interactions for Protein: Q3UZD7

Fam71f1, Protein FAM71F1, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam71f1Q3UZD7 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam71f1Q3UZD7 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Fam71f1Q3UZD7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam71f1Q3UZD7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam71f1Q3UZD7 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Fam71f1Q3UZD7 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Fam71f1Q3UZD7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam71f1Q3UZD7 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Fam71f1Q3UZD7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam71f1Q3UZD7 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam71f1Q3UZD7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Fam71f1Q3UZD7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fam71f1Q3UZD7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Fam71f1Q3UZD7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam71f1Q3UZD7 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam71f1Q3UZD7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Fam71f1Q3UZD7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Fam71f1Q3UZD7 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam71f1Q3UZD7 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam71f1Q3UZD7 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Fam71f1Q3UZD7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam71f1Q3UZD7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Fam71f1Q3UZD7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Fam71f1Q3UZD7 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam71f1Q3UZD7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Fam71f1Q3UZD7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Fam71f1Q3UZD7 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam71f1Q3UZD7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Fam71f1Q3UZD7 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam71f1Q3UZD7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Fam71f1Q3UZD7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Fam71f1Q3UZD7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam71f1Q3UZD7 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Fam71f1Q3UZD7 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam71f1Q3UZD7 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam71f1Q3UZD7 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam71f1Q3UZD7 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fam71f1Q3UZD7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam71f1Q3UZD7 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam71f1Q3UZD7 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Fam71f1Q3UZD7 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam71f1Q3UZD7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam71f1Q3UZD7 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fam71f1Q3UZD7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fam71f1Q3UZD7 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fam71f1Q3UZD7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Fam71f1Q3UZD7 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fam71f1Q3UZD7 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam71f1Q3UZD7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fam71f1Q3UZD7 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Fam71f1Q3UZD7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fam71f1Q3UZD7 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam71f1Q3UZD7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam71f1Q3UZD7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Fam71f1Q3UZD7 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam71f1Q3UZD7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Fam71f1Q3UZD7 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam71f1Q3UZD7 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam71f1Q3UZD7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fam71f1Q3UZD7 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Fam71f1Q3UZD7 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam71f1Q3UZD7 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fam71f1Q3UZD7 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam71f1Q3UZD7 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam71f1Q3UZD7 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam71f1Q3UZD7 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fam71f1Q3UZD7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam71f1Q3UZD7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fam71f1Q3UZD7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam71f1Q3UZD7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam71f1Q3UZD7 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam71f1Q3UZD7 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fam71f1Q3UZD7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fam71f1Q3UZD7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fam71f1Q3UZD7 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fam71f1Q3UZD7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam71f1Q3UZD7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam71f1Q3UZD7 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fam71f1Q3UZD7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam71f1Q3UZD7 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fam71f1Q3UZD7 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam71f1Q3UZD7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fam71f1Q3UZD7 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam71f1Q3UZD7 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Fam71f1Q3UZD7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fam71f1Q3UZD7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam71f1Q3UZD7 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fam71f1Q3UZD7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fam71f1Q3UZD7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fam71f1Q3UZD7 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fam71f1Q3UZD7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fam71f1Q3UZD7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Fam71f1Q3UZD7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Fam71f1Q3UZD7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam71f1Q3UZD7 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Fam71f1Q3UZD7 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Fam71f1Q3UZD7 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam71f1Q3UZD7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam71f1Q3UZD7 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Fam71f1Q3UZD7 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16 ms