Protein–RNA interactions for Protein: Q3UXB0

Mbd3l2, Methyl-CpG-binding domain protein 3-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mbd3l2Q3UXB0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Mbd3l2Q3UXB0 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Mbd3l2Q3UXB0 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Mbd3l2Q3UXB0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Mbd3l2Q3UXB0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Mbd3l2Q3UXB0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Mbd3l2Q3UXB0 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mbd3l2Q3UXB0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Mbd3l2Q3UXB0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mbd3l2Q3UXB0 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Mbd3l2Q3UXB0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mbd3l2Q3UXB0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mbd3l2Q3UXB0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Mbd3l2Q3UXB0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Mbd3l2Q3UXB0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mbd3l2Q3UXB0 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Mbd3l2Q3UXB0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mbd3l2Q3UXB0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mbd3l2Q3UXB0 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Mbd3l2Q3UXB0 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Mbd3l2Q3UXB0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mbd3l2Q3UXB0 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mbd3l2Q3UXB0 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mbd3l2Q3UXB0 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Mbd3l2Q3UXB0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mbd3l2Q3UXB0 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mbd3l2Q3UXB0 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Mbd3l2Q3UXB0 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Mbd3l2Q3UXB0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Mbd3l2Q3UXB0 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mbd3l2Q3UXB0 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Mbd3l2Q3UXB0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Mbd3l2Q3UXB0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Mbd3l2Q3UXB0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
Mbd3l2Q3UXB0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mbd3l2Q3UXB0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Mbd3l2Q3UXB0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mbd3l2Q3UXB0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mbd3l2Q3UXB0 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Mbd3l2Q3UXB0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Mbd3l2Q3UXB0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mbd3l2Q3UXB0 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
Mbd3l2Q3UXB0 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Mbd3l2Q3UXB0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mbd3l2Q3UXB0 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mbd3l2Q3UXB0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mbd3l2Q3UXB0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Mbd3l2Q3UXB0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Mbd3l2Q3UXB0 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Mbd3l2Q3UXB0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Mbd3l2Q3UXB0 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mbd3l2Q3UXB0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mbd3l2Q3UXB0 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mbd3l2Q3UXB0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mbd3l2Q3UXB0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Mbd3l2Q3UXB0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC19.69■□□□□ 0.74
Mbd3l2Q3UXB0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.68■□□□□ 0.74
Mbd3l2Q3UXB0 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19.68■□□□□ 0.74
Mbd3l2Q3UXB0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC19.67■□□□□ 0.74
Mbd3l2Q3UXB0 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mbd3l2Q3UXB0 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.67■□□□□ 0.74
Mbd3l2Q3UXB0 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mbd3l2Q3UXB0 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mbd3l2Q3UXB0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mbd3l2Q3UXB0 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mbd3l2Q3UXB0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mbd3l2Q3UXB0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.66■□□□□ 0.74
Mbd3l2Q3UXB0 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.65■□□□□ 0.74
Mbd3l2Q3UXB0 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mbd3l2Q3UXB0 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mbd3l2Q3UXB0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC19.63■□□□□ 0.73
Mbd3l2Q3UXB0 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mbd3l2Q3UXB0 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mbd3l2Q3UXB0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.62■□□□□ 0.73
Mbd3l2Q3UXB0 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mbd3l2Q3UXB0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mbd3l2Q3UXB0 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.61■□□□□ 0.73
Mbd3l2Q3UXB0 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mbd3l2Q3UXB0 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Mbd3l2Q3UXB0 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Mbd3l2Q3UXB0 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Mbd3l2Q3UXB0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Mbd3l2Q3UXB0 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Mbd3l2Q3UXB0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Mbd3l2Q3UXB0 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
Mbd3l2Q3UXB0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Mbd3l2Q3UXB0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75 ms