Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWM4

Kdm7a, Lysine-specific demethylase 7A, mousemouse

Predictions only

Length 940 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm7aQ3UWM4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Kdm7aQ3UWM4 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Kdm7aQ3UWM4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm7aQ3UWM4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
Kdm7aQ3UWM4 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm7aQ3UWM4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm7aQ3UWM4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Kdm7aQ3UWM4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Kdm7aQ3UWM4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Kdm7aQ3UWM4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Kdm7aQ3UWM4 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm7aQ3UWM4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Kdm7aQ3UWM4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Kdm7aQ3UWM4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Kdm7aQ3UWM4 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.99
Kdm7aQ3UWM4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.45■■□□□ 1.98
Kdm7aQ3UWM4 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Kdm7aQ3UWM4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Kdm7aQ3UWM4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Kdm7aQ3UWM4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Kdm7aQ3UWM4 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Kdm7aQ3UWM4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Kdm7aQ3UWM4 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Kdm7aQ3UWM4 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Kdm7aQ3UWM4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Kdm7aQ3UWM4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kdm7aQ3UWM4 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kdm7aQ3UWM4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kdm7aQ3UWM4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Kdm7aQ3UWM4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kdm7aQ3UWM4 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Kdm7aQ3UWM4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Kdm7aQ3UWM4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Kdm7aQ3UWM4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kdm7aQ3UWM4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Kdm7aQ3UWM4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Kdm7aQ3UWM4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Kdm7aQ3UWM4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Kdm7aQ3UWM4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Kdm7aQ3UWM4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Kdm7aQ3UWM4 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Kdm7aQ3UWM4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Kdm7aQ3UWM4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Kdm7aQ3UWM4 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Kdm7aQ3UWM4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Kdm7aQ3UWM4 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Kdm7aQ3UWM4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Kdm7aQ3UWM4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Kdm7aQ3UWM4 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
Kdm7aQ3UWM4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Kdm7aQ3UWM4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Kdm7aQ3UWM4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Kdm7aQ3UWM4 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Kdm7aQ3UWM4 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm7aQ3UWM4 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm7aQ3UWM4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm7aQ3UWM4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm7aQ3UWM4 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Kdm7aQ3UWM4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Kdm7aQ3UWM4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Kdm7aQ3UWM4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm7aQ3UWM4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm7aQ3UWM4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Kdm7aQ3UWM4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Kdm7aQ3UWM4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm7aQ3UWM4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm7aQ3UWM4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm7aQ3UWM4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Kdm7aQ3UWM4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm7aQ3UWM4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Kdm7aQ3UWM4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Kdm7aQ3UWM4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Kdm7aQ3UWM4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm7aQ3UWM4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm7aQ3UWM4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Kdm7aQ3UWM4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm7aQ3UWM4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Kdm7aQ3UWM4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm7aQ3UWM4 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm7aQ3UWM4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Kdm7aQ3UWM4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Kdm7aQ3UWM4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Kdm7aQ3UWM4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Kdm7aQ3UWM4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Kdm7aQ3UWM4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Kdm7aQ3UWM4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Kdm7aQ3UWM4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Kdm7aQ3UWM4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Kdm7aQ3UWM4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Kdm7aQ3UWM4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Kdm7aQ3UWM4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Kdm7aQ3UWM4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Kdm7aQ3UWM4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Kdm7aQ3UWM4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm7aQ3UWM4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Kdm7aQ3UWM4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm7aQ3UWM4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm7aQ3UWM4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Kdm7aQ3UWM4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Kdm7aQ3UWM4 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms