Protein–RNA interactions for Protein: Q3USJ8

Fchsd2, F-BAR and double SH3 domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 740 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fchsd2Q3USJ8 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.08■■■■□ 3.21
Fchsd2Q3USJ8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC35.06■■■■□ 3.2
Fchsd2Q3USJ8 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.01■■■■□ 3.19
Fchsd2Q3USJ8 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Fchsd2Q3USJ8 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Fchsd2Q3USJ8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Fchsd2Q3USJ8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Fchsd2Q3USJ8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Fchsd2Q3USJ8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Fchsd2Q3USJ8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC34.94■■■■□ 3.18
Fchsd2Q3USJ8 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Fchsd2Q3USJ8 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Fchsd2Q3USJ8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC34.88■■■■□ 3.17
Fchsd2Q3USJ8 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Fchsd2Q3USJ8 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC34.86■■■■□ 3.17
Fchsd2Q3USJ8 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Fchsd2Q3USJ8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC34.84■■■■□ 3.17
Fchsd2Q3USJ8 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Fchsd2Q3USJ8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC34.82■■■■□ 3.16
Fchsd2Q3USJ8 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Fchsd2Q3USJ8 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Fchsd2Q3USJ8 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Fchsd2Q3USJ8 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Fchsd2Q3USJ8 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Fchsd2Q3USJ8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Fchsd2Q3USJ8 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Fchsd2Q3USJ8 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Fchsd2Q3USJ8 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Fchsd2Q3USJ8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Fchsd2Q3USJ8 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Fchsd2Q3USJ8 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC34.68■■■■□ 3.14
Fchsd2Q3USJ8 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Fchsd2Q3USJ8 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Fchsd2Q3USJ8 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Fchsd2Q3USJ8 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Fchsd2Q3USJ8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Fchsd2Q3USJ8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
Fchsd2Q3USJ8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Fchsd2Q3USJ8 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Fchsd2Q3USJ8 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
Fchsd2Q3USJ8 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Fchsd2Q3USJ8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.59■■■■□ 3.13
Fchsd2Q3USJ8 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Fchsd2Q3USJ8 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Fchsd2Q3USJ8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
Fchsd2Q3USJ8 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Fchsd2Q3USJ8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Fchsd2Q3USJ8 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC34.52■■■■□ 3.12
Fchsd2Q3USJ8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.5■■■■□ 3.11
Fchsd2Q3USJ8 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.5■■■■□ 3.11
Fchsd2Q3USJ8 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Fchsd2Q3USJ8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC34.48■■■■□ 3.11
Fchsd2Q3USJ8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC34.48■■■■□ 3.11
Fchsd2Q3USJ8 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Fchsd2Q3USJ8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC34.43■■■■□ 3.1
Fchsd2Q3USJ8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC34.43■■■■□ 3.1
Fchsd2Q3USJ8 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Fchsd2Q3USJ8 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.42■■■■□ 3.1
Fchsd2Q3USJ8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Fchsd2Q3USJ8 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Fchsd2Q3USJ8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Fchsd2Q3USJ8 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Fchsd2Q3USJ8 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC34.37■■■■□ 3.09
Fchsd2Q3USJ8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Fchsd2Q3USJ8 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC34.36■■■■□ 3.09
Fchsd2Q3USJ8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Fchsd2Q3USJ8 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.33■■■■□ 3.09
Fchsd2Q3USJ8 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC34.32■■■■□ 3.08
Fchsd2Q3USJ8 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Fchsd2Q3USJ8 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC34.28■■■■□ 3.08
Fchsd2Q3USJ8 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC34.27■■■■□ 3.08
Fchsd2Q3USJ8 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Fchsd2Q3USJ8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Fchsd2Q3USJ8 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Fchsd2Q3USJ8 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Fchsd2Q3USJ8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.23■■■■□ 3.07
Fchsd2Q3USJ8 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC34.22■■■■□ 3.07
Fchsd2Q3USJ8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC34.21■■■■□ 3.07
Fchsd2Q3USJ8 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC34.18■■■■□ 3.06
Fchsd2Q3USJ8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC34.18■■■■□ 3.06
Fchsd2Q3USJ8 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.17■■■■□ 3.06
Fchsd2Q3USJ8 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Fchsd2Q3USJ8 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.14■■■■□ 3.06
Fchsd2Q3USJ8 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.12■■■■□ 3.05
Fchsd2Q3USJ8 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Fchsd2Q3USJ8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.1■■■■□ 3.05
Fchsd2Q3USJ8 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.1■■■■□ 3.05
Fchsd2Q3USJ8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.09■■■■□ 3.05
Fchsd2Q3USJ8 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Fchsd2Q3USJ8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Fchsd2Q3USJ8 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Fchsd2Q3USJ8 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.08■■■■□ 3.05
Fchsd2Q3USJ8 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.05
Fchsd2Q3USJ8 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC34.07■■■■□ 3.04
Fchsd2Q3USJ8 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Fchsd2Q3USJ8 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC34.07■■■■□ 3.04
Fchsd2Q3USJ8 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.04■■■■□ 3.04
Fchsd2Q3USJ8 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.03■■■■□ 3.04
Fchsd2Q3USJ8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC33.99■■■■□ 3.03
Fchsd2Q3USJ8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC33.98■■■■□ 3.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1310.9 ms