Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPE3

Rmi2, RecQ-mediated genome instability protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 149 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rmi2Q3UPE3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Rmi2Q3UPE3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Rmi2Q3UPE3 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Rmi2Q3UPE3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rmi2Q3UPE3 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rmi2Q3UPE3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Rmi2Q3UPE3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Rmi2Q3UPE3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rmi2Q3UPE3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Rmi2Q3UPE3 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rmi2Q3UPE3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rmi2Q3UPE3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rmi2Q3UPE3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rmi2Q3UPE3 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Rmi2Q3UPE3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Rmi2Q3UPE3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rmi2Q3UPE3 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rmi2Q3UPE3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Rmi2Q3UPE3 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rmi2Q3UPE3 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Rmi2Q3UPE3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rmi2Q3UPE3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rmi2Q3UPE3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Rmi2Q3UPE3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rmi2Q3UPE3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
Rmi2Q3UPE3 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rmi2Q3UPE3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rmi2Q3UPE3 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
Rmi2Q3UPE3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.42
Rmi2Q3UPE3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
Rmi2Q3UPE3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rmi2Q3UPE3 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Rmi2Q3UPE3 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Rmi2Q3UPE3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rmi2Q3UPE3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Rmi2Q3UPE3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rmi2Q3UPE3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Rmi2Q3UPE3 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rmi2Q3UPE3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Rmi2Q3UPE3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rmi2Q3UPE3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rmi2Q3UPE3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Rmi2Q3UPE3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rmi2Q3UPE3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rmi2Q3UPE3 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rmi2Q3UPE3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rmi2Q3UPE3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rmi2Q3UPE3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rmi2Q3UPE3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rmi2Q3UPE3 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rmi2Q3UPE3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rmi2Q3UPE3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rmi2Q3UPE3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rmi2Q3UPE3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rmi2Q3UPE3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rmi2Q3UPE3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rmi2Q3UPE3 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rmi2Q3UPE3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rmi2Q3UPE3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Rmi2Q3UPE3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Rmi2Q3UPE3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Rmi2Q3UPE3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rmi2Q3UPE3 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Rmi2Q3UPE3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Rmi2Q3UPE3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rmi2Q3UPE3 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rmi2Q3UPE3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Rmi2Q3UPE3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
Rmi2Q3UPE3 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rmi2Q3UPE3 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rmi2Q3UPE3 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rmi2Q3UPE3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Rmi2Q3UPE3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Rmi2Q3UPE3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Rmi2Q3UPE3 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rmi2Q3UPE3 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rmi2Q3UPE3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rmi2Q3UPE3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Rmi2Q3UPE3 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rmi2Q3UPE3 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Rmi2Q3UPE3 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Rmi2Q3UPE3 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Rmi2Q3UPE3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rmi2Q3UPE3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rmi2Q3UPE3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rmi2Q3UPE3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rmi2Q3UPE3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rmi2Q3UPE3 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Rmi2Q3UPE3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rmi2Q3UPE3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Rmi2Q3UPE3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rmi2Q3UPE3 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Rmi2Q3UPE3 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Rmi2Q3UPE3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Rmi2Q3UPE3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Rmi2Q3UPE3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rmi2Q3UPE3 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rmi2Q3UPE3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Rmi2Q3UPE3 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Rmi2Q3UPE3 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms