Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cog7Q3UM29 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Cog7Q3UM29 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Cog7Q3UM29 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Cog7Q3UM29 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Cog7Q3UM29 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Cog7Q3UM29 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Cog7Q3UM29 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Cog7Q3UM29 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cog7Q3UM29 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cog7Q3UM29 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Cog7Q3UM29 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cog7Q3UM29 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cog7Q3UM29 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
Cog7Q3UM29 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cog7Q3UM29 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cog7Q3UM29 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cog7Q3UM29 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cog7Q3UM29 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cog7Q3UM29 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cog7Q3UM29 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cog7Q3UM29 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cog7Q3UM29 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cog7Q3UM29 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cog7Q3UM29 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Cog7Q3UM29 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cog7Q3UM29 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cog7Q3UM29 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Cog7Q3UM29 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cog7Q3UM29 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cog7Q3UM29 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.45■■□□□ 1.82
Cog7Q3UM29 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cog7Q3UM29 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cog7Q3UM29 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cog7Q3UM29 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cog7Q3UM29 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cog7Q3UM29 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Cog7Q3UM29 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cog7Q3UM29 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cog7Q3UM29 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cog7Q3UM29 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cog7Q3UM29 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cog7Q3UM29 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cog7Q3UM29 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Cog7Q3UM29 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cog7Q3UM29 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cog7Q3UM29 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cog7Q3UM29 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cog7Q3UM29 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cog7Q3UM29 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cog7Q3UM29 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cog7Q3UM29 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cog7Q3UM29 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cog7Q3UM29 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Cog7Q3UM29 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cog7Q3UM29 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cog7Q3UM29 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cog7Q3UM29 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cog7Q3UM29 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cog7Q3UM29 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cog7Q3UM29 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.79
Cog7Q3UM29 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cog7Q3UM29 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
Cog7Q3UM29 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cog7Q3UM29 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cog7Q3UM29 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cog7Q3UM29 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cog7Q3UM29 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cog7Q3UM29 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cog7Q3UM29 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cog7Q3UM29 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cog7Q3UM29 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Cog7Q3UM29 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cog7Q3UM29 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC26.1■■□□□ 1.77
Cog7Q3UM29 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cog7Q3UM29 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cog7Q3UM29 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cog7Q3UM29 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cog7Q3UM29 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cog7Q3UM29 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cog7Q3UM29 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Cog7Q3UM29 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Cog7Q3UM29 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cog7Q3UM29 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cog7Q3UM29 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cog7Q3UM29 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Cog7Q3UM29 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.02■■□□□ 1.76
Cog7Q3UM29 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cog7Q3UM29 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Cog7Q3UM29 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Cog7Q3UM29 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Cog7Q3UM29 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Cog7Q3UM29 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cog7Q3UM29 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cog7Q3UM29 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cog7Q3UM29 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Cog7Q3UM29 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Cog7Q3UM29 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cog7Q3UM29 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Cog7Q3UM29 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms