Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHX0

Nol8, Nucleolar protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,147 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol8Q3UHX0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
Nol8Q3UHX0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
Nol8Q3UHX0 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
Nol8Q3UHX0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC32.07■■■□□ 2.72
Nol8Q3UHX0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
Nol8Q3UHX0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
Nol8Q3UHX0 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Nol8Q3UHX0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
Nol8Q3UHX0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC32.02■■■□□ 2.72
Nol8Q3UHX0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.72
Nol8Q3UHX0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
Nol8Q3UHX0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
Nol8Q3UHX0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
Nol8Q3UHX0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
Nol8Q3UHX0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.7
Nol8Q3UHX0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
Nol8Q3UHX0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
Nol8Q3UHX0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
Nol8Q3UHX0 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
Nol8Q3UHX0 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
Nol8Q3UHX0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
Nol8Q3UHX0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Nol8Q3UHX0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
Nol8Q3UHX0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
Nol8Q3UHX0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
Nol8Q3UHX0 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
Nol8Q3UHX0 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Nol8Q3UHX0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC31.78■■■□□ 2.68
Nol8Q3UHX0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
Nol8Q3UHX0 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC31.77■■■□□ 2.68
Nol8Q3UHX0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.76■■■□□ 2.67
Nol8Q3UHX0 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.74■■■□□ 2.67
Nol8Q3UHX0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC31.74■■■□□ 2.67
Nol8Q3UHX0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Nol8Q3UHX0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC31.73■■■□□ 2.67
Nol8Q3UHX0 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.7■■■□□ 2.66
Nol8Q3UHX0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Nol8Q3UHX0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.69■■■□□ 2.66
Nol8Q3UHX0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Nol8Q3UHX0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC31.66■■■□□ 2.66
Nol8Q3UHX0 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC31.66■■■□□ 2.66
Nol8Q3UHX0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC31.64■■■□□ 2.66
Nol8Q3UHX0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.63■■■□□ 2.65
Nol8Q3UHX0 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.59■■■□□ 2.65
Nol8Q3UHX0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC31.59■■■□□ 2.65
Nol8Q3UHX0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.58■■■□□ 2.65
Nol8Q3UHX0 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.56■■■□□ 2.64
Nol8Q3UHX0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC31.55■■■□□ 2.64
Nol8Q3UHX0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC31.53■■■□□ 2.64
Nol8Q3UHX0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.53■■■□□ 2.64
Nol8Q3UHX0 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.52■■■□□ 2.64
Nol8Q3UHX0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.51■■■□□ 2.64
Nol8Q3UHX0 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.5■■■□□ 2.63
Nol8Q3UHX0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Nol8Q3UHX0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.49■■■□□ 2.63
Nol8Q3UHX0 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.46■■■□□ 2.63
Nol8Q3UHX0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.63
Nol8Q3UHX0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC31.45■■■□□ 2.63
Nol8Q3UHX0 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC31.45■■■□□ 2.62
Nol8Q3UHX0 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC31.44■■■□□ 2.62
Nol8Q3UHX0 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.43■■■□□ 2.62
Nol8Q3UHX0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Nol8Q3UHX0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC31.42■■■□□ 2.62
Nol8Q3UHX0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.62
Nol8Q3UHX0 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Nol8Q3UHX0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
Nol8Q3UHX0 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
Nol8Q3UHX0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.33■■■□□ 2.61
Nol8Q3UHX0 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC31.29■■■□□ 2.6
Nol8Q3UHX0 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.29■■■□□ 2.6
Nol8Q3UHX0 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Nol8Q3UHX0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.28■■■□□ 2.6
Nol8Q3UHX0 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC31.28■■■□□ 2.6
Nol8Q3UHX0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.27■■■□□ 2.6
Nol8Q3UHX0 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.26■■■□□ 2.59
Nol8Q3UHX0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC31.26■■■□□ 2.59
Nol8Q3UHX0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Nol8Q3UHX0 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC31.25■■■□□ 2.59
Nol8Q3UHX0 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.25■■■□□ 2.59
Nol8Q3UHX0 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.24■■■□□ 2.59
Nol8Q3UHX0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC31.23■■■□□ 2.59
Nol8Q3UHX0 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.22■■■□□ 2.59
Nol8Q3UHX0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC31.21■■■□□ 2.59
Nol8Q3UHX0 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.21■■■□□ 2.59
Nol8Q3UHX0 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.2■■■□□ 2.59
Nol8Q3UHX0 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC31.2■■■□□ 2.59
Nol8Q3UHX0 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.19■■■□□ 2.58
Nol8Q3UHX0 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC31.18■■■□□ 2.58
Nol8Q3UHX0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.18■■■□□ 2.58
Nol8Q3UHX0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.17■■■□□ 2.58
Nol8Q3UHX0 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.16■■■□□ 2.58
Nol8Q3UHX0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Nol8Q3UHX0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Nol8Q3UHX0 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC31.15■■■□□ 2.58
Nol8Q3UHX0 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.15■■■□□ 2.58
Nol8Q3UHX0 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.12■■■□□ 2.57
Nol8Q3UHX0 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC31.1■■■□□ 2.57
Nol8Q3UHX0 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Nol8Q3UHX0 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC31.08■■■□□ 2.57
Nol8Q3UHX0 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms