Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY4

Rsph3a, Radial spoke head protein 3 homolog A, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rsph3aQ3UFY4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rsph3aQ3UFY4 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.09■■■□□ 2.57
Rsph3aQ3UFY4 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.08■■■□□ 2.57
Rsph3aQ3UFY4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.07■■■□□ 2.56
Rsph3aQ3UFY4 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rsph3aQ3UFY4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.06■■■□□ 2.56
Rsph3aQ3UFY4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.04■■■□□ 2.56
Rsph3aQ3UFY4 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.03■■■□□ 2.56
Rsph3aQ3UFY4 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Rsph3aQ3UFY4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Rsph3aQ3UFY4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.01■■■□□ 2.55
Rsph3aQ3UFY4 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC31■■■□□ 2.55
Rsph3aQ3UFY4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Rsph3aQ3UFY4 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC30.97■■■□□ 2.55
Rsph3aQ3UFY4 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Rsph3aQ3UFY4 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
Rsph3aQ3UFY4 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC30.93■■■□□ 2.54
Rsph3aQ3UFY4 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC30.92■■■□□ 2.54
Rsph3aQ3UFY4 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC30.9■■■□□ 2.54
Rsph3aQ3UFY4 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
Rsph3aQ3UFY4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rsph3aQ3UFY4 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rsph3aQ3UFY4 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
Rsph3aQ3UFY4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.84■■■□□ 2.53
Rsph3aQ3UFY4 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Rsph3aQ3UFY4 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC30.79■■■□□ 2.52
Rsph3aQ3UFY4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.78■■■□□ 2.52
Rsph3aQ3UFY4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.78■■■□□ 2.52
Rsph3aQ3UFY4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Rsph3aQ3UFY4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.77■■■□□ 2.52
Rsph3aQ3UFY4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.77■■■□□ 2.52
Rsph3aQ3UFY4 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.76■■■□□ 2.51
Rsph3aQ3UFY4 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.75■■■□□ 2.51
Rsph3aQ3UFY4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.74■■■□□ 2.51
Rsph3aQ3UFY4 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC30.73■■■□□ 2.51
Rsph3aQ3UFY4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.72■■■□□ 2.51
Rsph3aQ3UFY4 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.71■■■□□ 2.51
Rsph3aQ3UFY4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC30.7■■■□□ 2.51
Rsph3aQ3UFY4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Rsph3aQ3UFY4 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Rsph3aQ3UFY4 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC30.69■■■□□ 2.5
Rsph3aQ3UFY4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rsph3aQ3UFY4 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rsph3aQ3UFY4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.67■■■□□ 2.5
Rsph3aQ3UFY4 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Rsph3aQ3UFY4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.63■■■□□ 2.49
Rsph3aQ3UFY4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Rsph3aQ3UFY4 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Rsph3aQ3UFY4 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC30.61■■■□□ 2.49
Rsph3aQ3UFY4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Rsph3aQ3UFY4 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.59■■■□□ 2.49
Rsph3aQ3UFY4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Rsph3aQ3UFY4 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Rsph3aQ3UFY4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Rsph3aQ3UFY4 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC30.58■■■□□ 2.49
Rsph3aQ3UFY4 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.48
Rsph3aQ3UFY4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Rsph3aQ3UFY4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Rsph3aQ3UFY4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Rsph3aQ3UFY4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.54■■■□□ 2.48
Rsph3aQ3UFY4 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC30.54■■■□□ 2.48
Rsph3aQ3UFY4 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rsph3aQ3UFY4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Rsph3aQ3UFY4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rsph3aQ3UFY4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.49■■■□□ 2.47
Rsph3aQ3UFY4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Rsph3aQ3UFY4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.47■■■□□ 2.47
Rsph3aQ3UFY4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Rsph3aQ3UFY4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Rsph3aQ3UFY4 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.44■■■□□ 2.46
Rsph3aQ3UFY4 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rsph3aQ3UFY4 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC30.43■■■□□ 2.46
Rsph3aQ3UFY4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.43■■■□□ 2.46
Rsph3aQ3UFY4 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Rsph3aQ3UFY4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rsph3aQ3UFY4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.41■■■□□ 2.46
Rsph3aQ3UFY4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC30.4■■■□□ 2.46
Rsph3aQ3UFY4 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rsph3aQ3UFY4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Rsph3aQ3UFY4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Rsph3aQ3UFY4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rsph3aQ3UFY4 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC30.37■■■□□ 2.45
Rsph3aQ3UFY4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.37■■■□□ 2.45
Rsph3aQ3UFY4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Rsph3aQ3UFY4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rsph3aQ3UFY4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rsph3aQ3UFY4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Rsph3aQ3UFY4 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.31■■■□□ 2.44
Rsph3aQ3UFY4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Rsph3aQ3UFY4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Rsph3aQ3UFY4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rsph3aQ3UFY4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC30.27■■■□□ 2.44
Rsph3aQ3UFY4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC30.26■■■□□ 2.43
Rsph3aQ3UFY4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Rsph3aQ3UFY4 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30.25■■■□□ 2.43
Rsph3aQ3UFY4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC30.2■■■□□ 2.43
Rsph3aQ3UFY4 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Rsph3aQ3UFY4 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rsph3aQ3UFY4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC30.17■■■□□ 2.42
Rsph3aQ3UFY4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.16■■■□□ 2.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms