Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 57 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cops9Q3U898 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cops9Q3U898 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cops9Q3U898 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cops9Q3U898 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Cops9Q3U898 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cops9Q3U898 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cops9Q3U898 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Cops9Q3U898 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cops9Q3U898 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cops9Q3U898 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cops9Q3U898 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Cops9Q3U898 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cops9Q3U898 Gatad1-202ENSMUST00000119783 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cops9Q3U898 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Cops9Q3U898 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Cops9Q3U898 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cops9Q3U898 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cops9Q3U898 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Cops9Q3U898 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Cops9Q3U898 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Cops9Q3U898 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cops9Q3U898 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Cops9Q3U898 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cops9Q3U898 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cops9Q3U898 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cops9Q3U898 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cops9Q3U898 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Cops9Q3U898 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cops9Q3U898 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Cops9Q3U898 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cops9Q3U898 Arhgdig-201ENSMUST00000025019 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cops9Q3U898 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Cops9Q3U898 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Cops9Q3U898 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cops9Q3U898 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Cops9Q3U898 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Cops9Q3U898 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cops9Q3U898 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cops9Q3U898 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Cops9Q3U898 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cops9Q3U898 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cops9Q3U898 Kdm2a-208ENSMUST00000176483 1128 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cops9Q3U898 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Cops9Q3U898 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Cops9Q3U898 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cops9Q3U898 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Cops9Q3U898 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cops9Q3U898 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cops9Q3U898 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Cops9Q3U898 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Cops9Q3U898 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cops9Q3U898 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
Cops9Q3U898 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
Cops9Q3U898 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
Cops9Q3U898 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cops9Q3U898 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
Cops9Q3U898 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
Cops9Q3U898 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cops9Q3U898 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.63■□□□□ 0.41
Cops9Q3U898 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cops9Q3U898 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cops9Q3U898 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cops9Q3U898 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.62■□□□□ 0.41
Cops9Q3U898 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cops9Q3U898 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cops9Q3U898 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
Cops9Q3U898 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cops9Q3U898 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Cops9Q3U898 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Cops9Q3U898 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Cops9Q3U898 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Cops9Q3U898 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Cops9Q3U898 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cops9Q3U898 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Cops9Q3U898 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cops9Q3U898 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Cops9Q3U898 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cops9Q3U898 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cops9Q3U898 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Cops9Q3U898 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Cops9Q3U898 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
Cops9Q3U898 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Cops9Q3U898 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cops9Q3U898 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Cops9Q3U898 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cops9Q3U898 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cops9Q3U898 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Cops9Q3U898 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cops9Q3U898 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Cops9Q3U898 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Cops9Q3U898 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Cops9Q3U898 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cops9Q3U898 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cops9Q3U898 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Cops9Q3U898 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cops9Q3U898 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cops9Q3U898 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Cops9Q3U898 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Cops9Q3U898 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.5 ms