Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4S0

Pank2, Pantothenate kinase 2, mousemouse

Predictions only

Length 443 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pank2Q3U4S0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Pank2Q3U4S0 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
Pank2Q3U4S0 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pank2Q3U4S0 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
Pank2Q3U4S0 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
Pank2Q3U4S0 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Pank2Q3U4S0 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Pank2Q3U4S0 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Pank2Q3U4S0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pank2Q3U4S0 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Pank2Q3U4S0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Pank2Q3U4S0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.25
Pank2Q3U4S0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pank2Q3U4S0 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Pank2Q3U4S0 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
Pank2Q3U4S0 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC29.09■■■□□ 2.25
Pank2Q3U4S0 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Pank2Q3U4S0 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pank2Q3U4S0 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
Pank2Q3U4S0 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pank2Q3U4S0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
Pank2Q3U4S0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
Pank2Q3U4S0 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pank2Q3U4S0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC29.04■■■□□ 2.24
Pank2Q3U4S0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
Pank2Q3U4S0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC29.01■■■□□ 2.24
Pank2Q3U4S0 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pank2Q3U4S0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pank2Q3U4S0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Pank2Q3U4S0 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Pank2Q3U4S0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pank2Q3U4S0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Pank2Q3U4S0 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Pank2Q3U4S0 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Pank2Q3U4S0 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pank2Q3U4S0 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Pank2Q3U4S0 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Pank2Q3U4S0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Pank2Q3U4S0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pank2Q3U4S0 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Pank2Q3U4S0 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Pank2Q3U4S0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pank2Q3U4S0 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Pank2Q3U4S0 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Pank2Q3U4S0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Pank2Q3U4S0 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Pank2Q3U4S0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pank2Q3U4S0 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Pank2Q3U4S0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Pank2Q3U4S0 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pank2Q3U4S0 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Pank2Q3U4S0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pank2Q3U4S0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Pank2Q3U4S0 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pank2Q3U4S0 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pank2Q3U4S0 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
Pank2Q3U4S0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
Pank2Q3U4S0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
Pank2Q3U4S0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
Pank2Q3U4S0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
Pank2Q3U4S0 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
Pank2Q3U4S0 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.64■■■□□ 2.17
Pank2Q3U4S0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pank2Q3U4S0 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
Pank2Q3U4S0 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pank2Q3U4S0 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
Pank2Q3U4S0 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
Pank2Q3U4S0 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pank2Q3U4S0 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pank2Q3U4S0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pank2Q3U4S0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
Pank2Q3U4S0 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pank2Q3U4S0 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
Pank2Q3U4S0 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
Pank2Q3U4S0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
Pank2Q3U4S0 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
Pank2Q3U4S0 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC28.52■■■□□ 2.16
Pank2Q3U4S0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Pank2Q3U4S0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC28.51■■■□□ 2.15
Pank2Q3U4S0 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pank2Q3U4S0 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Pank2Q3U4S0 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
Pank2Q3U4S0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Pank2Q3U4S0 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
Pank2Q3U4S0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Pank2Q3U4S0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pank2Q3U4S0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Pank2Q3U4S0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pank2Q3U4S0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pank2Q3U4S0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Pank2Q3U4S0 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Pank2Q3U4S0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pank2Q3U4S0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Pank2Q3U4S0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pank2Q3U4S0 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pank2Q3U4S0 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pank2Q3U4S0 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Pank2Q3U4S0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Pank2Q3U4S0 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Pank2Q3U4S0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms