Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ssbp4Q3U4B1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Ssbp4Q3U4B1 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ssbp4Q3U4B1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ssbp4Q3U4B1 Ldb1-207ENSMUST00000156585 2014 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ssbp4Q3U4B1 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssbp4Q3U4B1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssbp4Q3U4B1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ssbp4Q3U4B1 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssbp4Q3U4B1 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ssbp4Q3U4B1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssbp4Q3U4B1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ssbp4Q3U4B1 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ssbp4Q3U4B1 Fam241a-202ENSMUST00000199273 2234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssbp4Q3U4B1 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ssbp4Q3U4B1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssbp4Q3U4B1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ssbp4Q3U4B1 Wsb2-201ENSMUST00000031309 2421 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ssbp4Q3U4B1 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ssbp4Q3U4B1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ssbp4Q3U4B1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ssbp4Q3U4B1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ssbp4Q3U4B1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ssbp4Q3U4B1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ssbp4Q3U4B1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ssbp4Q3U4B1 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ssbp4Q3U4B1 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssbp4Q3U4B1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ssbp4Q3U4B1 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ssbp4Q3U4B1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssbp4Q3U4B1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Ssbp4Q3U4B1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Ssbp4Q3U4B1 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssbp4Q3U4B1 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Ssbp4Q3U4B1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Ssbp4Q3U4B1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssbp4Q3U4B1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Ssbp4Q3U4B1 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Ssbp4Q3U4B1 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssbp4Q3U4B1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssbp4Q3U4B1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Ssbp4Q3U4B1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssbp4Q3U4B1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssbp4Q3U4B1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Ssbp4Q3U4B1 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssbp4Q3U4B1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Ssbp4Q3U4B1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Ssbp4Q3U4B1 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssbp4Q3U4B1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssbp4Q3U4B1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssbp4Q3U4B1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Ssbp4Q3U4B1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Ssbp4Q3U4B1 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Ssbp4Q3U4B1 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Ssbp4Q3U4B1 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Ssbp4Q3U4B1 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssbp4Q3U4B1 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Ssbp4Q3U4B1 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ssbp4Q3U4B1 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Ssbp4Q3U4B1 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ssbp4Q3U4B1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ssbp4Q3U4B1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Ssbp4Q3U4B1 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Ssbp4Q3U4B1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ssbp4Q3U4B1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
Ssbp4Q3U4B1 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Ssbp4Q3U4B1 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Ssbp4Q3U4B1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ssbp4Q3U4B1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ssbp4Q3U4B1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
Ssbp4Q3U4B1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Ssbp4Q3U4B1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ssbp4Q3U4B1 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ssbp4Q3U4B1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ssbp4Q3U4B1 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Ssbp4Q3U4B1 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Ssbp4Q3U4B1 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Ssbp4Q3U4B1 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ssbp4Q3U4B1 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ssbp4Q3U4B1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ssbp4Q3U4B1 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ssbp4Q3U4B1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Ssbp4Q3U4B1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ssbp4Q3U4B1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Ssbp4Q3U4B1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Ssbp4Q3U4B1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Ssbp4Q3U4B1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ssbp4Q3U4B1 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ssbp4Q3U4B1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Ssbp4Q3U4B1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ssbp4Q3U4B1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ssbp4Q3U4B1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Ssbp4Q3U4B1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Ssbp4Q3U4B1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssbp4Q3U4B1 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssbp4Q3U4B1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssbp4Q3U4B1 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Ssbp4Q3U4B1 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Ssbp4Q3U4B1 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Ssbp4Q3U4B1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.4 ms