Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3R4

Lmf1, Lipase maturation factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmf1Q3U3R4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Lmf1Q3U3R4 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
Lmf1Q3U3R4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lmf1Q3U3R4 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.67■■□□□ 1.86
Lmf1Q3U3R4 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Lmf1Q3U3R4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Lmf1Q3U3R4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lmf1Q3U3R4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Lmf1Q3U3R4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lmf1Q3U3R4 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Lmf1Q3U3R4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Lmf1Q3U3R4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
Lmf1Q3U3R4 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lmf1Q3U3R4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Lmf1Q3U3R4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Lmf1Q3U3R4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lmf1Q3U3R4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Lmf1Q3U3R4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Lmf1Q3U3R4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lmf1Q3U3R4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lmf1Q3U3R4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Lmf1Q3U3R4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Lmf1Q3U3R4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lmf1Q3U3R4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Lmf1Q3U3R4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Lmf1Q3U3R4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Lmf1Q3U3R4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
Lmf1Q3U3R4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lmf1Q3U3R4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Lmf1Q3U3R4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Lmf1Q3U3R4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Lmf1Q3U3R4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
Lmf1Q3U3R4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Lmf1Q3U3R4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Lmf1Q3U3R4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Lmf1Q3U3R4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lmf1Q3U3R4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Lmf1Q3U3R4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Lmf1Q3U3R4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Lmf1Q3U3R4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
Lmf1Q3U3R4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.8
Lmf1Q3U3R4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmf1Q3U3R4 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Lmf1Q3U3R4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Lmf1Q3U3R4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmf1Q3U3R4 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Lmf1Q3U3R4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Lmf1Q3U3R4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Lmf1Q3U3R4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lmf1Q3U3R4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lmf1Q3U3R4 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Lmf1Q3U3R4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Lmf1Q3U3R4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lmf1Q3U3R4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Lmf1Q3U3R4 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lmf1Q3U3R4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Lmf1Q3U3R4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lmf1Q3U3R4 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lmf1Q3U3R4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Lmf1Q3U3R4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lmf1Q3U3R4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Lmf1Q3U3R4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Lmf1Q3U3R4 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Lmf1Q3U3R4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lmf1Q3U3R4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lmf1Q3U3R4 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Lmf1Q3U3R4 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Lmf1Q3U3R4 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Lmf1Q3U3R4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Lmf1Q3U3R4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Lmf1Q3U3R4 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Lmf1Q3U3R4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.05■■□□□ 1.76
Lmf1Q3U3R4 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lmf1Q3U3R4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Lmf1Q3U3R4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lmf1Q3U3R4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Lmf1Q3U3R4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lmf1Q3U3R4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lmf1Q3U3R4 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Lmf1Q3U3R4 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lmf1Q3U3R4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Lmf1Q3U3R4 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lmf1Q3U3R4 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Lmf1Q3U3R4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
Lmf1Q3U3R4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Lmf1Q3U3R4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lmf1Q3U3R4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Lmf1Q3U3R4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lmf1Q3U3R4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Lmf1Q3U3R4 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lmf1Q3U3R4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lmf1Q3U3R4 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Lmf1Q3U3R4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Lmf1Q3U3R4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lmf1Q3U3R4 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lmf1Q3U3R4 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Lmf1Q3U3R4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Lmf1Q3U3R4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lmf1Q3U3R4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Lmf1Q3U3R4 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms