Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

Predictions only

Length 472 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
Ulk3Q3U3Q1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Ulk3Q3U3Q1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Ulk3Q3U3Q1 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Ulk3Q3U3Q1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ulk3Q3U3Q1 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ulk3Q3U3Q1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ulk3Q3U3Q1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ulk3Q3U3Q1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ulk3Q3U3Q1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ulk3Q3U3Q1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ulk3Q3U3Q1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ulk3Q3U3Q1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ulk3Q3U3Q1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ulk3Q3U3Q1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ulk3Q3U3Q1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Ulk3Q3U3Q1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Ulk3Q3U3Q1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Ulk3Q3U3Q1 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ulk3Q3U3Q1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ulk3Q3U3Q1 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ulk3Q3U3Q1 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ulk3Q3U3Q1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ulk3Q3U3Q1 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ulk3Q3U3Q1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ulk3Q3U3Q1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ulk3Q3U3Q1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ulk3Q3U3Q1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ulk3Q3U3Q1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ulk3Q3U3Q1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ulk3Q3U3Q1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ulk3Q3U3Q1 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ulk3Q3U3Q1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ulk3Q3U3Q1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ulk3Q3U3Q1 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Ulk3Q3U3Q1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ulk3Q3U3Q1 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ulk3Q3U3Q1 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ulk3Q3U3Q1 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ulk3Q3U3Q1 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Ulk3Q3U3Q1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Ulk3Q3U3Q1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Ulk3Q3U3Q1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Ulk3Q3U3Q1 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Ulk3Q3U3Q1 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ulk3Q3U3Q1 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Ulk3Q3U3Q1 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ulk3Q3U3Q1 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Ulk3Q3U3Q1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ulk3Q3U3Q1 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ulk3Q3U3Q1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Ulk3Q3U3Q1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Ulk3Q3U3Q1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Ulk3Q3U3Q1 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Ulk3Q3U3Q1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Ulk3Q3U3Q1 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Ulk3Q3U3Q1 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ulk3Q3U3Q1 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ulk3Q3U3Q1 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ulk3Q3U3Q1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ulk3Q3U3Q1 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ulk3Q3U3Q1 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ulk3Q3U3Q1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ulk3Q3U3Q1 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ulk3Q3U3Q1 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ulk3Q3U3Q1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ulk3Q3U3Q1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ulk3Q3U3Q1 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ulk3Q3U3Q1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
Ulk3Q3U3Q1 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ulk3Q3U3Q1 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ulk3Q3U3Q1 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ulk3Q3U3Q1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ulk3Q3U3Q1 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ulk3Q3U3Q1 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ulk3Q3U3Q1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ulk3Q3U3Q1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ulk3Q3U3Q1 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ulk3Q3U3Q1 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ulk3Q3U3Q1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ulk3Q3U3Q1 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ulk3Q3U3Q1 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ulk3Q3U3Q1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ulk3Q3U3Q1 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ulk3Q3U3Q1 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ulk3Q3U3Q1 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ulk3Q3U3Q1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ulk3Q3U3Q1 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ulk3Q3U3Q1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ulk3Q3U3Q1 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ulk3Q3U3Q1 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ulk3Q3U3Q1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ulk3Q3U3Q1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ulk3Q3U3Q1 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ulk3Q3U3Q1 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ulk3Q3U3Q1 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ulk3Q3U3Q1 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ulk3Q3U3Q1 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ulk3Q3U3Q1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ulk3Q3U3Q1 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
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