Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2C5

Rnf149, E3 ubiquitin-protein ligase RNF149, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf149Q3U2C5 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rnf149Q3U2C5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Rnf149Q3U2C5 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Rnf149Q3U2C5 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf149Q3U2C5 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf149Q3U2C5 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Rnf149Q3U2C5 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rnf149Q3U2C5 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Rnf149Q3U2C5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Rnf149Q3U2C5 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Rnf149Q3U2C5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf149Q3U2C5 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Rnf149Q3U2C5 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Rnf149Q3U2C5 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Rnf149Q3U2C5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf149Q3U2C5 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf149Q3U2C5 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Rnf149Q3U2C5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf149Q3U2C5 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Rnf149Q3U2C5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf149Q3U2C5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Rnf149Q3U2C5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf149Q3U2C5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf149Q3U2C5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Rnf149Q3U2C5 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Rnf149Q3U2C5 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Rnf149Q3U2C5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf149Q3U2C5 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Rnf149Q3U2C5 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Rnf149Q3U2C5 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf149Q3U2C5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf149Q3U2C5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Rnf149Q3U2C5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf149Q3U2C5 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Rnf149Q3U2C5 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Rnf149Q3U2C5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Rnf149Q3U2C5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf149Q3U2C5 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Rnf149Q3U2C5 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Rnf149Q3U2C5 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf149Q3U2C5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf149Q3U2C5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Rnf149Q3U2C5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Rnf149Q3U2C5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Rnf149Q3U2C5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf149Q3U2C5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Rnf149Q3U2C5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf149Q3U2C5 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Rnf149Q3U2C5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Rnf149Q3U2C5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.83■■□□□ 1.24
Rnf149Q3U2C5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf149Q3U2C5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf149Q3U2C5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Rnf149Q3U2C5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf149Q3U2C5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf149Q3U2C5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Rnf149Q3U2C5 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Rnf149Q3U2C5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf149Q3U2C5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf149Q3U2C5 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf149Q3U2C5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rnf149Q3U2C5 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf149Q3U2C5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rnf149Q3U2C5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rnf149Q3U2C5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf149Q3U2C5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf149Q3U2C5 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf149Q3U2C5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf149Q3U2C5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rnf149Q3U2C5 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf149Q3U2C5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rnf149Q3U2C5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rnf149Q3U2C5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf149Q3U2C5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Rnf149Q3U2C5 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf149Q3U2C5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Rnf149Q3U2C5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf149Q3U2C5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Rnf149Q3U2C5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf149Q3U2C5 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf149Q3U2C5 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Rnf149Q3U2C5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Rnf149Q3U2C5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf149Q3U2C5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf149Q3U2C5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf149Q3U2C5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Rnf149Q3U2C5 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Rnf149Q3U2C5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf149Q3U2C5 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rnf149Q3U2C5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf149Q3U2C5 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rnf149Q3U2C5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rnf149Q3U2C5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf149Q3U2C5 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rnf149Q3U2C5 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf149Q3U2C5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf149Q3U2C5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rnf149Q3U2C5 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.52■■□□□ 1.19
Rnf149Q3U2C5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rnf149Q3U2C5 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms