Protein–RNA interactions for Protein: Q3TZA2

Cdkl4, Cyclin-dependent kinase-like 4, mousemouse

Predictions only

Length 342 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdkl4Q3TZA2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cdkl4Q3TZA2 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cdkl4Q3TZA2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Cdkl4Q3TZA2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cdkl4Q3TZA2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cdkl4Q3TZA2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cdkl4Q3TZA2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cdkl4Q3TZA2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Cdkl4Q3TZA2 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cdkl4Q3TZA2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdkl4Q3TZA2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Cdkl4Q3TZA2 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Cdkl4Q3TZA2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cdkl4Q3TZA2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cdkl4Q3TZA2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cdkl4Q3TZA2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cdkl4Q3TZA2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cdkl4Q3TZA2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cdkl4Q3TZA2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdkl4Q3TZA2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Cdkl4Q3TZA2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdkl4Q3TZA2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC26.16■■□□□ 1.78
Cdkl4Q3TZA2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cdkl4Q3TZA2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdkl4Q3TZA2 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdkl4Q3TZA2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Cdkl4Q3TZA2 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Cdkl4Q3TZA2 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC26.08■■□□□ 1.77
Cdkl4Q3TZA2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Cdkl4Q3TZA2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdkl4Q3TZA2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Cdkl4Q3TZA2 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdkl4Q3TZA2 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
Cdkl4Q3TZA2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdkl4Q3TZA2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Cdkl4Q3TZA2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdkl4Q3TZA2 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdkl4Q3TZA2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdkl4Q3TZA2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdkl4Q3TZA2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Cdkl4Q3TZA2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Cdkl4Q3TZA2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdkl4Q3TZA2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdkl4Q3TZA2 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Cdkl4Q3TZA2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Cdkl4Q3TZA2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdkl4Q3TZA2 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Cdkl4Q3TZA2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdkl4Q3TZA2 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Cdkl4Q3TZA2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Cdkl4Q3TZA2 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Cdkl4Q3TZA2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdkl4Q3TZA2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdkl4Q3TZA2 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Cdkl4Q3TZA2 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdkl4Q3TZA2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdkl4Q3TZA2 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Cdkl4Q3TZA2 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Cdkl4Q3TZA2 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdkl4Q3TZA2 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdkl4Q3TZA2 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdkl4Q3TZA2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Cdkl4Q3TZA2 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdkl4Q3TZA2 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cdkl4Q3TZA2 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdkl4Q3TZA2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdkl4Q3TZA2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cdkl4Q3TZA2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cdkl4Q3TZA2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cdkl4Q3TZA2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cdkl4Q3TZA2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cdkl4Q3TZA2 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdkl4Q3TZA2 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cdkl4Q3TZA2 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdkl4Q3TZA2 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cdkl4Q3TZA2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cdkl4Q3TZA2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdkl4Q3TZA2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cdkl4Q3TZA2 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdkl4Q3TZA2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cdkl4Q3TZA2 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Cdkl4Q3TZA2 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Cdkl4Q3TZA2 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Cdkl4Q3TZA2 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdkl4Q3TZA2 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Cdkl4Q3TZA2 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdkl4Q3TZA2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdkl4Q3TZA2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Cdkl4Q3TZA2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdkl4Q3TZA2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Cdkl4Q3TZA2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Cdkl4Q3TZA2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Cdkl4Q3TZA2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdkl4Q3TZA2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Cdkl4Q3TZA2 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Cdkl4Q3TZA2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdkl4Q3TZA2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Cdkl4Q3TZA2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdkl4Q3TZA2 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Cdkl4Q3TZA2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.6 ms