Protein–RNA interactions for Protein: Q3TUH1

Tamm41, Phosphatidate cytidylyltransferase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tamm41Q3TUH1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tamm41Q3TUH1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tamm41Q3TUH1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tamm41Q3TUH1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tamm41Q3TUH1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Tamm41Q3TUH1 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Tamm41Q3TUH1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Tamm41Q3TUH1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Tamm41Q3TUH1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tamm41Q3TUH1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Tamm41Q3TUH1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Tamm41Q3TUH1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tamm41Q3TUH1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Tamm41Q3TUH1 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tamm41Q3TUH1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tamm41Q3TUH1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Tamm41Q3TUH1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tamm41Q3TUH1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tamm41Q3TUH1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Tamm41Q3TUH1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tamm41Q3TUH1 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Tamm41Q3TUH1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tamm41Q3TUH1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tamm41Q3TUH1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Tamm41Q3TUH1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Tamm41Q3TUH1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tamm41Q3TUH1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tamm41Q3TUH1 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tamm41Q3TUH1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Tamm41Q3TUH1 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tamm41Q3TUH1 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tamm41Q3TUH1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tamm41Q3TUH1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tamm41Q3TUH1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tamm41Q3TUH1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tamm41Q3TUH1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tamm41Q3TUH1 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tamm41Q3TUH1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tamm41Q3TUH1 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tamm41Q3TUH1 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tamm41Q3TUH1 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tamm41Q3TUH1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tamm41Q3TUH1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tamm41Q3TUH1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tamm41Q3TUH1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tamm41Q3TUH1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tamm41Q3TUH1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tamm41Q3TUH1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tamm41Q3TUH1 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tamm41Q3TUH1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Tamm41Q3TUH1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Tamm41Q3TUH1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tamm41Q3TUH1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Tamm41Q3TUH1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tamm41Q3TUH1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Tamm41Q3TUH1 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
Tamm41Q3TUH1 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tamm41Q3TUH1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Tamm41Q3TUH1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tamm41Q3TUH1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tamm41Q3TUH1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tamm41Q3TUH1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Tamm41Q3TUH1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tamm41Q3TUH1 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tamm41Q3TUH1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tamm41Q3TUH1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tamm41Q3TUH1 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tamm41Q3TUH1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tamm41Q3TUH1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tamm41Q3TUH1 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tamm41Q3TUH1 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tamm41Q3TUH1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tamm41Q3TUH1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tamm41Q3TUH1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tamm41Q3TUH1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tamm41Q3TUH1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tamm41Q3TUH1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tamm41Q3TUH1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tamm41Q3TUH1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tamm41Q3TUH1 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tamm41Q3TUH1 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tamm41Q3TUH1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tamm41Q3TUH1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tamm41Q3TUH1 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tamm41Q3TUH1 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tamm41Q3TUH1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tamm41Q3TUH1 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tamm41Q3TUH1 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tamm41Q3TUH1 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tamm41Q3TUH1 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tamm41Q3TUH1 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Tamm41Q3TUH1 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tamm41Q3TUH1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tamm41Q3TUH1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tamm41Q3TUH1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tamm41Q3TUH1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tamm41Q3TUH1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tamm41Q3TUH1 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tamm41Q3TUH1 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tamm41Q3TUH1 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms