Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Gtf3c3Q3TMP1 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
Gtf3c3Q3TMP1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
Gtf3c3Q3TMP1 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
Gtf3c3Q3TMP1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
Gtf3c3Q3TMP1 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
Gtf3c3Q3TMP1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Gtf3c3Q3TMP1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Gtf3c3Q3TMP1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
Gtf3c3Q3TMP1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
Gtf3c3Q3TMP1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.53
Gtf3c3Q3TMP1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
Gtf3c3Q3TMP1 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.83■■■□□ 2.53
Gtf3c3Q3TMP1 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC30.82■■■□□ 2.52
Gtf3c3Q3TMP1 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Gtf3c3Q3TMP1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC30.82■■■□□ 2.52
Gtf3c3Q3TMP1 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC30.81■■■□□ 2.52
Gtf3c3Q3TMP1 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC30.8■■■□□ 2.52
Gtf3c3Q3TMP1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.8■■■□□ 2.52
Gtf3c3Q3TMP1 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC30.76■■■□□ 2.51
Gtf3c3Q3TMP1 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.75■■■□□ 2.51
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.73■■■□□ 2.51
Gtf3c3Q3TMP1 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC30.72■■■□□ 2.51
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Gtf3c3Q3TMP1 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC30.71■■■□□ 2.51
Gtf3c3Q3TMP1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.71■■■□□ 2.51
Gtf3c3Q3TMP1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC30.68■■■□□ 2.5
Gtf3c3Q3TMP1 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.68■■■□□ 2.5
Gtf3c3Q3TMP1 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.66■■■□□ 2.5
Gtf3c3Q3TMP1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.65■■■□□ 2.5
Gtf3c3Q3TMP1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC30.64■■■□□ 2.5
Gtf3c3Q3TMP1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Gtf3c3Q3TMP1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.63■■■□□ 2.49
Gtf3c3Q3TMP1 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.62■■■□□ 2.49
Gtf3c3Q3TMP1 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Gtf3c3Q3TMP1 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.61■■■□□ 2.49
Gtf3c3Q3TMP1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Gtf3c3Q3TMP1 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.6■■■□□ 2.49
Gtf3c3Q3TMP1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC30.58■■■□□ 2.49
Gtf3c3Q3TMP1 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.57■■■□□ 2.49
Gtf3c3Q3TMP1 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Gtf3c3Q3TMP1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Gtf3c3Q3TMP1 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.56■■■□□ 2.48
Gtf3c3Q3TMP1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC30.54■■■□□ 2.48
Gtf3c3Q3TMP1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.53■■■□□ 2.48
Gtf3c3Q3TMP1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Gtf3c3Q3TMP1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC30.53■■■□□ 2.48
Gtf3c3Q3TMP1 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.52■■■□□ 2.48
Gtf3c3Q3TMP1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.48
Gtf3c3Q3TMP1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.51■■■□□ 2.47
Gtf3c3Q3TMP1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.5■■■□□ 2.47
Gtf3c3Q3TMP1 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC30.5■■■□□ 2.47
Gtf3c3Q3TMP1 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC30.5■■■□□ 2.47
Gtf3c3Q3TMP1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.49■■■□□ 2.47
Gtf3c3Q3TMP1 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Gtf3c3Q3TMP1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC30.48■■■□□ 2.47
Gtf3c3Q3TMP1 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC30.48■■■□□ 2.47
Gtf3c3Q3TMP1 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Gtf3c3Q3TMP1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.46■■■□□ 2.47
Gtf3c3Q3TMP1 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC30.45■■■□□ 2.47
Gtf3c3Q3TMP1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Gtf3c3Q3TMP1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.45■■■□□ 2.46
Gtf3c3Q3TMP1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.44■■■□□ 2.46
Gtf3c3Q3TMP1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Gtf3c3Q3TMP1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.42■■■□□ 2.46
Gtf3c3Q3TMP1 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC30.41■■■□□ 2.46
Gtf3c3Q3TMP1 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Gtf3c3Q3TMP1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.39■■■□□ 2.46
Gtf3c3Q3TMP1 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.38■■■□□ 2.45
Gtf3c3Q3TMP1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC30.36■■■□□ 2.45
Gtf3c3Q3TMP1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC30.36■■■□□ 2.45
Gtf3c3Q3TMP1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC30.33■■■□□ 2.45
Gtf3c3Q3TMP1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.32■■■□□ 2.44
Gtf3c3Q3TMP1 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.31■■■□□ 2.44
Gtf3c3Q3TMP1 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.3■■■□□ 2.44
Gtf3c3Q3TMP1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.29■■■□□ 2.44
Gtf3c3Q3TMP1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.26■■■□□ 2.43
Gtf3c3Q3TMP1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.25■■■□□ 2.43
Gtf3c3Q3TMP1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Gtf3c3Q3TMP1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.22■■■□□ 2.43
Gtf3c3Q3TMP1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Gtf3c3Q3TMP1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Gtf3c3Q3TMP1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.19■■■□□ 2.42
Gtf3c3Q3TMP1 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.18■■■□□ 2.42
Gtf3c3Q3TMP1 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC30.16■■■□□ 2.42
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Gtf3c3Q3TMP1 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Gtf3c3Q3TMP1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.15■■■□□ 2.42
Gtf3c3Q3TMP1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.14■■■□□ 2.42
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC30.14■■■□□ 2.41
Gtf3c3Q3TMP1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC30.11■■■□□ 2.41
Gtf3c3Q3TMP1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC30.09■■■□□ 2.41
Gtf3c3Q3TMP1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC30.09■■■□□ 2.41
Gtf3c3Q3TMP1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Gtf3c3Q3TMP1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.07■■■□□ 2.4
Gtf3c3Q3TMP1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC30.06■■■□□ 2.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.2 ms