Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLD5

Uri1, Unconventional prefoldin RPB5 interactor, mousemouse

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uri1Q3TLD5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Uri1Q3TLD5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Uri1Q3TLD5 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Uri1Q3TLD5 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Uri1Q3TLD5 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
Uri1Q3TLD5 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
Uri1Q3TLD5 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Uri1Q3TLD5 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
Uri1Q3TLD5 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
Uri1Q3TLD5 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
Uri1Q3TLD5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
Uri1Q3TLD5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Uri1Q3TLD5 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
Uri1Q3TLD5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Uri1Q3TLD5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
Uri1Q3TLD5 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
Uri1Q3TLD5 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
Uri1Q3TLD5 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
Uri1Q3TLD5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
Uri1Q3TLD5 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
Uri1Q3TLD5 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
Uri1Q3TLD5 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
Uri1Q3TLD5 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Uri1Q3TLD5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Uri1Q3TLD5 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
Uri1Q3TLD5 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
Uri1Q3TLD5 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Uri1Q3TLD5 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Uri1Q3TLD5 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
Uri1Q3TLD5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
Uri1Q3TLD5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
Uri1Q3TLD5 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
Uri1Q3TLD5 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
Uri1Q3TLD5 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
Uri1Q3TLD5 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
Uri1Q3TLD5 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Uri1Q3TLD5 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Uri1Q3TLD5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Uri1Q3TLD5 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Uri1Q3TLD5 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Uri1Q3TLD5 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
Uri1Q3TLD5 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
Uri1Q3TLD5 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC27.72■■■□□ 2.03
Uri1Q3TLD5 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.71■■■□□ 2.03
Uri1Q3TLD5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
Uri1Q3TLD5 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Uri1Q3TLD5 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
Uri1Q3TLD5 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.65■■■□□ 2.02
Uri1Q3TLD5 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.64■■■□□ 2.02
Uri1Q3TLD5 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
Uri1Q3TLD5 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
Uri1Q3TLD5 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Uri1Q3TLD5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
Uri1Q3TLD5 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Uri1Q3TLD5 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Uri1Q3TLD5 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
Uri1Q3TLD5 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Uri1Q3TLD5 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Uri1Q3TLD5 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
Uri1Q3TLD5 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Uri1Q3TLD5 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
Uri1Q3TLD5 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Uri1Q3TLD5 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Uri1Q3TLD5 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.56■■■□□ 2
Uri1Q3TLD5 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
Uri1Q3TLD5 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Uri1Q3TLD5 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Uri1Q3TLD5 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Uri1Q3TLD5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Uri1Q3TLD5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Uri1Q3TLD5 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Uri1Q3TLD5 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Uri1Q3TLD5 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Uri1Q3TLD5 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Uri1Q3TLD5 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Uri1Q3TLD5 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Uri1Q3TLD5 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Uri1Q3TLD5 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Uri1Q3TLD5 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Uri1Q3TLD5 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Uri1Q3TLD5 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Uri1Q3TLD5 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Uri1Q3TLD5 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Uri1Q3TLD5 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Uri1Q3TLD5 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
Uri1Q3TLD5 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Uri1Q3TLD5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Uri1Q3TLD5 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Uri1Q3TLD5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Uri1Q3TLD5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Uri1Q3TLD5 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Uri1Q3TLD5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Uri1Q3TLD5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Uri1Q3TLD5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
Uri1Q3TLD5 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Uri1Q3TLD5 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Uri1Q3TLD5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Uri1Q3TLD5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Uri1Q3TLD5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Uri1Q3TLD5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms