Protein–RNA interactions for Protein: Q3TL54

Trim43a, Tripartite motif-containing protein 43A, mousemouse

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim43aQ3TL54 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
Trim43aQ3TL54 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
Trim43aQ3TL54 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
Trim43aQ3TL54 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2
Trim43aQ3TL54 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Trim43aQ3TL54 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC27.57■■■□□ 2
Trim43aQ3TL54 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trim43aQ3TL54 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Trim43aQ3TL54 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trim43aQ3TL54 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Trim43aQ3TL54 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Trim43aQ3TL54 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC27.53■■■□□ 2
Trim43aQ3TL54 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Trim43aQ3TL54 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Trim43aQ3TL54 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim43aQ3TL54 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Trim43aQ3TL54 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Trim43aQ3TL54 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trim43aQ3TL54 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Trim43aQ3TL54 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trim43aQ3TL54 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Trim43aQ3TL54 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Trim43aQ3TL54 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim43aQ3TL54 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Trim43aQ3TL54 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Trim43aQ3TL54 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trim43aQ3TL54 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Trim43aQ3TL54 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.97
Trim43aQ3TL54 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.38■■□□□ 1.97
Trim43aQ3TL54 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Trim43aQ3TL54 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Trim43aQ3TL54 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trim43aQ3TL54 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Trim43aQ3TL54 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Trim43aQ3TL54 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Trim43aQ3TL54 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trim43aQ3TL54 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC27.34■■□□□ 1.97
Trim43aQ3TL54 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim43aQ3TL54 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Trim43aQ3TL54 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim43aQ3TL54 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Trim43aQ3TL54 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Trim43aQ3TL54 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim43aQ3TL54 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim43aQ3TL54 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Trim43aQ3TL54 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Trim43aQ3TL54 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trim43aQ3TL54 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Trim43aQ3TL54 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Trim43aQ3TL54 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Trim43aQ3TL54 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Trim43aQ3TL54 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim43aQ3TL54 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Trim43aQ3TL54 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim43aQ3TL54 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Trim43aQ3TL54 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim43aQ3TL54 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Trim43aQ3TL54 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.95
Trim43aQ3TL54 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Trim43aQ3TL54 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Trim43aQ3TL54 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim43aQ3TL54 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Trim43aQ3TL54 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim43aQ3TL54 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim43aQ3TL54 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim43aQ3TL54 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Trim43aQ3TL54 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trim43aQ3TL54 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Trim43aQ3TL54 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trim43aQ3TL54 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Trim43aQ3TL54 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Trim43aQ3TL54 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Trim43aQ3TL54 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim43aQ3TL54 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim43aQ3TL54 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Trim43aQ3TL54 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trim43aQ3TL54 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Trim43aQ3TL54 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim43aQ3TL54 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim43aQ3TL54 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim43aQ3TL54 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Trim43aQ3TL54 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Trim43aQ3TL54 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Trim43aQ3TL54 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Trim43aQ3TL54 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim43aQ3TL54 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim43aQ3TL54 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim43aQ3TL54 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Trim43aQ3TL54 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Trim43aQ3TL54 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Trim43aQ3TL54 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Trim43aQ3TL54 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Trim43aQ3TL54 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim43aQ3TL54 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Trim43aQ3TL54 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim43aQ3TL54 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Trim43aQ3TL54 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim43aQ3TL54 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim43aQ3TL54 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Trim43aQ3TL54 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 216.7 ms