Protein–RNA interactions for Protein: Q3TKR2

Xlr4c, X-linked lymphocyte-regulated 4C, mousemouse

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xlr4cQ3TKR2 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xlr4cQ3TKR2 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Xlr4cQ3TKR2 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xlr4cQ3TKR2 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Xlr4cQ3TKR2 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xlr4cQ3TKR2 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Xlr4cQ3TKR2 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xlr4cQ3TKR2 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xlr4cQ3TKR2 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Xlr4cQ3TKR2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Xlr4cQ3TKR2 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Xlr4cQ3TKR2 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Xlr4cQ3TKR2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Xlr4cQ3TKR2 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Xlr4cQ3TKR2 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Xlr4cQ3TKR2 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Xlr4cQ3TKR2 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Xlr4cQ3TKR2 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Xlr4cQ3TKR2 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Xlr4cQ3TKR2 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Xlr4cQ3TKR2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Xlr4cQ3TKR2 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Xlr4cQ3TKR2 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Xlr4cQ3TKR2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Xlr4cQ3TKR2 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Xlr4cQ3TKR2 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Xlr4cQ3TKR2 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Xlr4cQ3TKR2 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Xlr4cQ3TKR2 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Xlr4cQ3TKR2 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
Xlr4cQ3TKR2 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Xlr4cQ3TKR2 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xlr4cQ3TKR2 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Xlr4cQ3TKR2 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xlr4cQ3TKR2 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Xlr4cQ3TKR2 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xlr4cQ3TKR2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Xlr4cQ3TKR2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Xlr4cQ3TKR2 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xlr4cQ3TKR2 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xlr4cQ3TKR2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xlr4cQ3TKR2 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xlr4cQ3TKR2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xlr4cQ3TKR2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Xlr4cQ3TKR2 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Xlr4cQ3TKR2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xlr4cQ3TKR2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Xlr4cQ3TKR2 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Xlr4cQ3TKR2 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xlr4cQ3TKR2 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Xlr4cQ3TKR2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xlr4cQ3TKR2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Xlr4cQ3TKR2 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xlr4cQ3TKR2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Xlr4cQ3TKR2 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Xlr4cQ3TKR2 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xlr4cQ3TKR2 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xlr4cQ3TKR2 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xlr4cQ3TKR2 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xlr4cQ3TKR2 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Xlr4cQ3TKR2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Xlr4cQ3TKR2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Xlr4cQ3TKR2 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Xlr4cQ3TKR2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Xlr4cQ3TKR2 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Xlr4cQ3TKR2 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Xlr4cQ3TKR2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Xlr4cQ3TKR2 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Xlr4cQ3TKR2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Xlr4cQ3TKR2 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Xlr4cQ3TKR2 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Xlr4cQ3TKR2 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Xlr4cQ3TKR2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Xlr4cQ3TKR2 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Xlr4cQ3TKR2 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Xlr4cQ3TKR2 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Xlr4cQ3TKR2 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Xlr4cQ3TKR2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Xlr4cQ3TKR2 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Xlr4cQ3TKR2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Xlr4cQ3TKR2 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Xlr4cQ3TKR2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Xlr4cQ3TKR2 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Xlr4cQ3TKR2 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Xlr4cQ3TKR2 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xlr4cQ3TKR2 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xlr4cQ3TKR2 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xlr4cQ3TKR2 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xlr4cQ3TKR2 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xlr4cQ3TKR2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Xlr4cQ3TKR2 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Xlr4cQ3TKR2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Xlr4cQ3TKR2 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Xlr4cQ3TKR2 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Xlr4cQ3TKR2 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Xlr4cQ3TKR2 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Xlr4cQ3TKR2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Xlr4cQ3TKR2 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xlr4cQ3TKR2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Xlr4cQ3TKR2 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 43.6 ms