Protein–RNA interactions for Protein: Q3TC46

Patl1, Protein PAT1 homolog 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Patl1Q3TC46 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Patl1Q3TC46 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Patl1Q3TC46 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Patl1Q3TC46 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Patl1Q3TC46 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Patl1Q3TC46 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Patl1Q3TC46 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Patl1Q3TC46 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Patl1Q3TC46 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Patl1Q3TC46 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Patl1Q3TC46 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Patl1Q3TC46 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Patl1Q3TC46 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Patl1Q3TC46 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Patl1Q3TC46 Agpat2-201ENSMUST00000028286 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Patl1Q3TC46 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Patl1Q3TC46 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Patl1Q3TC46 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Patl1Q3TC46 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Patl1Q3TC46 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Patl1Q3TC46 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Patl1Q3TC46 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Patl1Q3TC46 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Patl1Q3TC46 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Patl1Q3TC46 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Patl1Q3TC46 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Patl1Q3TC46 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Patl1Q3TC46 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Patl1Q3TC46 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Patl1Q3TC46 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Patl1Q3TC46 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Patl1Q3TC46 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Patl1Q3TC46 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Patl1Q3TC46 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Patl1Q3TC46 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Patl1Q3TC46 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Patl1Q3TC46 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Patl1Q3TC46 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Patl1Q3TC46 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Patl1Q3TC46 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Patl1Q3TC46 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Patl1Q3TC46 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Patl1Q3TC46 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Patl1Q3TC46 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Patl1Q3TC46 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Patl1Q3TC46 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Patl1Q3TC46 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Patl1Q3TC46 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Patl1Q3TC46 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Patl1Q3TC46 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Patl1Q3TC46 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Patl1Q3TC46 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Patl1Q3TC46 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Patl1Q3TC46 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Patl1Q3TC46 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Patl1Q3TC46 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Patl1Q3TC46 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Patl1Q3TC46 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Patl1Q3TC46 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Patl1Q3TC46 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Patl1Q3TC46 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Patl1Q3TC46 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Patl1Q3TC46 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Patl1Q3TC46 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Patl1Q3TC46 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Patl1Q3TC46 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Patl1Q3TC46 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Patl1Q3TC46 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Patl1Q3TC46 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Patl1Q3TC46 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Patl1Q3TC46 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Patl1Q3TC46 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Patl1Q3TC46 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Patl1Q3TC46 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Patl1Q3TC46 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Patl1Q3TC46 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Patl1Q3TC46 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Patl1Q3TC46 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Patl1Q3TC46 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Patl1Q3TC46 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Patl1Q3TC46 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Patl1Q3TC46 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Patl1Q3TC46 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Patl1Q3TC46 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Patl1Q3TC46 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Patl1Q3TC46 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Patl1Q3TC46 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Patl1Q3TC46 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Patl1Q3TC46 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Patl1Q3TC46 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Patl1Q3TC46 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Patl1Q3TC46 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Patl1Q3TC46 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Patl1Q3TC46 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Patl1Q3TC46 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
Patl1Q3TC46 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Patl1Q3TC46 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Patl1Q3TC46 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Patl1Q3TC46 Crk-204ENSMUST00000108426 671 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Patl1Q3TC46 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.2 ms