Protein–RNA interactions for Protein: Q3TA59

Jmjd8, JmjC domain-containing protein 8, mousemouse

Predictions only

Length 316 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jmjd8Q3TA59 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Jmjd8Q3TA59 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Jmjd8Q3TA59 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Jmjd8Q3TA59 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Jmjd8Q3TA59 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Jmjd8Q3TA59 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Jmjd8Q3TA59 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Jmjd8Q3TA59 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Jmjd8Q3TA59 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Jmjd8Q3TA59 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Jmjd8Q3TA59 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Jmjd8Q3TA59 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Jmjd8Q3TA59 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Jmjd8Q3TA59 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Jmjd8Q3TA59 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Jmjd8Q3TA59 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Jmjd8Q3TA59 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Jmjd8Q3TA59 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Jmjd8Q3TA59 Vps37d-201ENSMUST00000067935 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Jmjd8Q3TA59 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Jmjd8Q3TA59 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Jmjd8Q3TA59 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Jmjd8Q3TA59 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Jmjd8Q3TA59 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Jmjd8Q3TA59 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Jmjd8Q3TA59 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Jmjd8Q3TA59 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Jmjd8Q3TA59 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Jmjd8Q3TA59 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Jmjd8Q3TA59 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Jmjd8Q3TA59 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Jmjd8Q3TA59 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Jmjd8Q3TA59 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Jmjd8Q3TA59 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Jmjd8Q3TA59 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Jmjd8Q3TA59 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Jmjd8Q3TA59 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Jmjd8Q3TA59 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Jmjd8Q3TA59 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
Jmjd8Q3TA59 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Jmjd8Q3TA59 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Jmjd8Q3TA59 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Jmjd8Q3TA59 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Jmjd8Q3TA59 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Jmjd8Q3TA59 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Jmjd8Q3TA59 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Jmjd8Q3TA59 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Jmjd8Q3TA59 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Jmjd8Q3TA59 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Jmjd8Q3TA59 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Jmjd8Q3TA59 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Jmjd8Q3TA59 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Jmjd8Q3TA59 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Jmjd8Q3TA59 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Jmjd8Q3TA59 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Jmjd8Q3TA59 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Jmjd8Q3TA59 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Jmjd8Q3TA59 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Jmjd8Q3TA59 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Jmjd8Q3TA59 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Jmjd8Q3TA59 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Jmjd8Q3TA59 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Jmjd8Q3TA59 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Jmjd8Q3TA59 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Jmjd8Q3TA59 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Jmjd8Q3TA59 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Jmjd8Q3TA59 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Jmjd8Q3TA59 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Jmjd8Q3TA59 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Jmjd8Q3TA59 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Jmjd8Q3TA59 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Jmjd8Q3TA59 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Jmjd8Q3TA59 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Jmjd8Q3TA59 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Jmjd8Q3TA59 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Jmjd8Q3TA59 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Jmjd8Q3TA59 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Jmjd8Q3TA59 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Jmjd8Q3TA59 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Jmjd8Q3TA59 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Jmjd8Q3TA59 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Jmjd8Q3TA59 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Jmjd8Q3TA59 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Jmjd8Q3TA59 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Jmjd8Q3TA59 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Jmjd8Q3TA59 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Jmjd8Q3TA59 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Jmjd8Q3TA59 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Jmjd8Q3TA59 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Jmjd8Q3TA59 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Jmjd8Q3TA59 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Jmjd8Q3TA59 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Jmjd8Q3TA59 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Jmjd8Q3TA59 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Jmjd8Q3TA59 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Jmjd8Q3TA59 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Jmjd8Q3TA59 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Jmjd8Q3TA59 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Jmjd8Q3TA59 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Jmjd8Q3TA59 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms