Protein–RNA interactions for Protein: Q3T9M1

Mfsd2b, Major facilitator superfamily domain-containing protein 2B, mousemouse

Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mfsd2bQ3T9M1 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Mfsd2bQ3T9M1 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Mfsd2bQ3T9M1 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Mfsd2bQ3T9M1 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Mfsd2bQ3T9M1 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Mfsd2bQ3T9M1 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Mfsd2bQ3T9M1 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Mfsd2bQ3T9M1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mfsd2bQ3T9M1 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mfsd2bQ3T9M1 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Mfsd2bQ3T9M1 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Mfsd2bQ3T9M1 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Mfsd2bQ3T9M1 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mfsd2bQ3T9M1 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Mfsd2bQ3T9M1 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Mfsd2bQ3T9M1 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Mfsd2bQ3T9M1 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Mfsd2bQ3T9M1 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Mfsd2bQ3T9M1 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Mfsd2bQ3T9M1 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mfsd2bQ3T9M1 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mfsd2bQ3T9M1 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mfsd2bQ3T9M1 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Mfsd2bQ3T9M1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mfsd2bQ3T9M1 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mfsd2bQ3T9M1 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mfsd2bQ3T9M1 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Mfsd2bQ3T9M1 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mfsd2bQ3T9M1 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Mfsd2bQ3T9M1 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mfsd2bQ3T9M1 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Mfsd2bQ3T9M1 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Mfsd2bQ3T9M1 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Mfsd2bQ3T9M1 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mfsd2bQ3T9M1 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Mfsd2bQ3T9M1 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mfsd2bQ3T9M1 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mfsd2bQ3T9M1 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Mfsd2bQ3T9M1 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Mfsd2bQ3T9M1 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Mfsd2bQ3T9M1 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Mfsd2bQ3T9M1 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Mfsd2bQ3T9M1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mfsd2bQ3T9M1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mfsd2bQ3T9M1 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Mfsd2bQ3T9M1 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mfsd2bQ3T9M1 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Mfsd2bQ3T9M1 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mfsd2bQ3T9M1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Mfsd2bQ3T9M1 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Mfsd2bQ3T9M1 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Mfsd2bQ3T9M1 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mfsd2bQ3T9M1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Mfsd2bQ3T9M1 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mfsd2bQ3T9M1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mfsd2bQ3T9M1 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Mfsd2bQ3T9M1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mfsd2bQ3T9M1 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mfsd2bQ3T9M1 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Mfsd2bQ3T9M1 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
Mfsd2bQ3T9M1 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mfsd2bQ3T9M1 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mfsd2bQ3T9M1 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Mfsd2bQ3T9M1 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Mfsd2bQ3T9M1 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mfsd2bQ3T9M1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Mfsd2bQ3T9M1 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mfsd2bQ3T9M1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Mfsd2bQ3T9M1 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mfsd2bQ3T9M1 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Mfsd2bQ3T9M1 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Mfsd2bQ3T9M1 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mfsd2bQ3T9M1 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Mfsd2bQ3T9M1 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mfsd2bQ3T9M1 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Mfsd2bQ3T9M1 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Mfsd2bQ3T9M1 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Mfsd2bQ3T9M1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Mfsd2bQ3T9M1 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mfsd2bQ3T9M1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Mfsd2bQ3T9M1 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Mfsd2bQ3T9M1 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Mfsd2bQ3T9M1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mfsd2bQ3T9M1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Mfsd2bQ3T9M1 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Mfsd2bQ3T9M1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mfsd2bQ3T9M1 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Mfsd2bQ3T9M1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Mfsd2bQ3T9M1 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Mfsd2bQ3T9M1 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Mfsd2bQ3T9M1 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Mfsd2bQ3T9M1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Mfsd2bQ3T9M1 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Mfsd2bQ3T9M1 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Mfsd2bQ3T9M1 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Mfsd2bQ3T9M1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Mfsd2bQ3T9M1 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mfsd2bQ3T9M1 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Mfsd2bQ3T9M1 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Mfsd2bQ3T9M1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.6 ms