Protein–RNA interactions for Protein: Q33DR3

Pdss2, Decaprenyl-diphosphate synthase subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 401 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdss2Q33DR3 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Pdss2Q33DR3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdss2Q33DR3 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdss2Q33DR3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Pdss2Q33DR3 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Pdss2Q33DR3 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdss2Q33DR3 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdss2Q33DR3 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Pdss2Q33DR3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdss2Q33DR3 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Pdss2Q33DR3 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Pdss2Q33DR3 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Pdss2Q33DR3 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Pdss2Q33DR3 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdss2Q33DR3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Pdss2Q33DR3 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdss2Q33DR3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pdss2Q33DR3 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdss2Q33DR3 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pdss2Q33DR3 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pdss2Q33DR3 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pdss2Q33DR3 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdss2Q33DR3 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdss2Q33DR3 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pdss2Q33DR3 Bzw1-202ENSMUST00000186949 1492 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pdss2Q33DR3 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdss2Q33DR3 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pdss2Q33DR3 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pdss2Q33DR3 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pdss2Q33DR3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pdss2Q33DR3 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdss2Q33DR3 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pdss2Q33DR3 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdss2Q33DR3 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdss2Q33DR3 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdss2Q33DR3 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pdss2Q33DR3 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdss2Q33DR3 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pdss2Q33DR3 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pdss2Q33DR3 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdss2Q33DR3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pdss2Q33DR3 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Pdss2Q33DR3 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdss2Q33DR3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Pdss2Q33DR3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdss2Q33DR3 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdss2Q33DR3 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdss2Q33DR3 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdss2Q33DR3 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Pdss2Q33DR3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdss2Q33DR3 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Pdss2Q33DR3 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Pdss2Q33DR3 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdss2Q33DR3 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdss2Q33DR3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdss2Q33DR3 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Pdss2Q33DR3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdss2Q33DR3 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Pdss2Q33DR3 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Pdss2Q33DR3 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdss2Q33DR3 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Pdss2Q33DR3 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdss2Q33DR3 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Pdss2Q33DR3 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdss2Q33DR3 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdss2Q33DR3 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdss2Q33DR3 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Pdss2Q33DR3 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdss2Q33DR3 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Pdss2Q33DR3 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Pdss2Q33DR3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Pdss2Q33DR3 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Pdss2Q33DR3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdss2Q33DR3 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdss2Q33DR3 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Pdss2Q33DR3 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdss2Q33DR3 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdss2Q33DR3 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Pdss2Q33DR3 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdss2Q33DR3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Pdss2Q33DR3 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Pdss2Q33DR3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Pdss2Q33DR3 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdss2Q33DR3 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdss2Q33DR3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Pdss2Q33DR3 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Pdss2Q33DR3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdss2Q33DR3 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdss2Q33DR3 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdss2Q33DR3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Pdss2Q33DR3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Pdss2Q33DR3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdss2Q33DR3 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Pdss2Q33DR3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Pdss2Q33DR3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Pdss2Q33DR3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdss2Q33DR3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdss2Q33DR3 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdss2Q33DR3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Pdss2Q33DR3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 112.9 ms