Protein–RNA interactions for Protein: Q208S0

Teddm2, Epididymal protein Me9, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Teddm2Q208S0 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Teddm2Q208S0 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Teddm2Q208S0 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Teddm2Q208S0 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Teddm2Q208S0 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Teddm2Q208S0 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Teddm2Q208S0 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Teddm2Q208S0 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Teddm2Q208S0 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Teddm2Q208S0 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Teddm2Q208S0 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Teddm2Q208S0 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Teddm2Q208S0 Rundc3a-201ENSMUST00000006750 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Teddm2Q208S0 Gnai2-201ENSMUST00000055704 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Teddm2Q208S0 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Teddm2Q208S0 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Teddm2Q208S0 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Teddm2Q208S0 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Teddm2Q208S0 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Teddm2Q208S0 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Teddm2Q208S0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Teddm2Q208S0 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Teddm2Q208S0 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Teddm2Q208S0 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Teddm2Q208S0 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Teddm2Q208S0 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Teddm2Q208S0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Teddm2Q208S0 Gm26859-201ENSMUST00000181743 1852 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Teddm2Q208S0 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Teddm2Q208S0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
Teddm2Q208S0 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Teddm2Q208S0 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Teddm2Q208S0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Teddm2Q208S0 Dennd1b-209ENSMUST00000200533 1853 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Teddm2Q208S0 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Teddm2Q208S0 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Teddm2Q208S0 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Teddm2Q208S0 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Teddm2Q208S0 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Teddm2Q208S0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.73■■□□□ 1.55
Teddm2Q208S0 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Teddm2Q208S0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Teddm2Q208S0 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Teddm2Q208S0 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Teddm2Q208S0 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Teddm2Q208S0 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Teddm2Q208S0 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Teddm2Q208S0 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Teddm2Q208S0 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Teddm2Q208S0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Teddm2Q208S0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Teddm2Q208S0 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Teddm2Q208S0 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Teddm2Q208S0 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Teddm2Q208S0 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Teddm2Q208S0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Teddm2Q208S0 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Teddm2Q208S0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Teddm2Q208S0 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Teddm2Q208S0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Teddm2Q208S0 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Teddm2Q208S0 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Teddm2Q208S0 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Teddm2Q208S0 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Teddm2Q208S0 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Teddm2Q208S0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Teddm2Q208S0 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Teddm2Q208S0 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Teddm2Q208S0 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Teddm2Q208S0 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Teddm2Q208S0 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Teddm2Q208S0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Teddm2Q208S0 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Teddm2Q208S0 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Teddm2Q208S0 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Teddm2Q208S0 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Teddm2Q208S0 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Teddm2Q208S0 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Teddm2Q208S0 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Teddm2Q208S0 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Teddm2Q208S0 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Teddm2Q208S0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Teddm2Q208S0 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Teddm2Q208S0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Teddm2Q208S0 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Teddm2Q208S0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Teddm2Q208S0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Teddm2Q208S0 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Teddm2Q208S0 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Teddm2Q208S0 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Teddm2Q208S0 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Teddm2Q208S0 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Teddm2Q208S0 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Teddm2Q208S0 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Teddm2Q208S0 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Teddm2Q208S0 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Teddm2Q208S0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Teddm2Q208S0 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Teddm2Q208S0 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Teddm2Q208S0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.7 ms