Protein–RNA interactions for Protein: Q14AI6

Rpusd3, Mitochondrial mRNA pseudouridine synthase Rpusd3, mousemouse

Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpusd3Q14AI6 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpusd3Q14AI6 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Rpusd3Q14AI6 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpusd3Q14AI6 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpusd3Q14AI6 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Rpusd3Q14AI6 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Rpusd3Q14AI6 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpusd3Q14AI6 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpusd3Q14AI6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Rpusd3Q14AI6 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpusd3Q14AI6 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Rpusd3Q14AI6 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpusd3Q14AI6 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Rpusd3Q14AI6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpusd3Q14AI6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rpusd3Q14AI6 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpusd3Q14AI6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rpusd3Q14AI6 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpusd3Q14AI6 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpusd3Q14AI6 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rpusd3Q14AI6 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpusd3Q14AI6 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Rpusd3Q14AI6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpusd3Q14AI6 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpusd3Q14AI6 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rpusd3Q14AI6 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rpusd3Q14AI6 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpusd3Q14AI6 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpusd3Q14AI6 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Rpusd3Q14AI6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Rpusd3Q14AI6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rpusd3Q14AI6 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rpusd3Q14AI6 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rpusd3Q14AI6 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpusd3Q14AI6 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpusd3Q14AI6 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rpusd3Q14AI6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpusd3Q14AI6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpusd3Q14AI6 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rpusd3Q14AI6 Ilk-201ENSMUST00000033182 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rpusd3Q14AI6 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpusd3Q14AI6 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpusd3Q14AI6 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpusd3Q14AI6 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpusd3Q14AI6 Lrrc1-204ENSMUST00000183734 2113 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpusd3Q14AI6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rpusd3Q14AI6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rpusd3Q14AI6 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpusd3Q14AI6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpusd3Q14AI6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rpusd3Q14AI6 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpusd3Q14AI6 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpusd3Q14AI6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rpusd3Q14AI6 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpusd3Q14AI6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpusd3Q14AI6 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpusd3Q14AI6 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rpusd3Q14AI6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Rpusd3Q14AI6 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Rpusd3Q14AI6 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Rpusd3Q14AI6 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpusd3Q14AI6 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Rpusd3Q14AI6 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rpusd3Q14AI6 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rpusd3Q14AI6 Casp9-202ENSMUST00000097805 1498 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rpusd3Q14AI6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Rpusd3Q14AI6 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpusd3Q14AI6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Rpusd3Q14AI6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpusd3Q14AI6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Rpusd3Q14AI6 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Rpusd3Q14AI6 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Rpusd3Q14AI6 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpusd3Q14AI6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Rpusd3Q14AI6 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Rpusd3Q14AI6 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Rpusd3Q14AI6 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Rpusd3Q14AI6 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpusd3Q14AI6 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Rpusd3Q14AI6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Rpusd3Q14AI6 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpusd3Q14AI6 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Rpusd3Q14AI6 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Rpusd3Q14AI6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpusd3Q14AI6 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpusd3Q14AI6 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Rpusd3Q14AI6 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Rpusd3Q14AI6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpusd3Q14AI6 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpusd3Q14AI6 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpusd3Q14AI6 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpusd3Q14AI6 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Rpusd3Q14AI6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpusd3Q14AI6 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpusd3Q14AI6 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpusd3Q14AI6 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpusd3Q14AI6 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Rpusd3Q14AI6 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Rpusd3Q14AI6 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Rpusd3Q14AI6 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms