Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Samd12Q0VE29 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Samd12Q0VE29 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Samd12Q0VE29 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Samd12Q0VE29 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Samd12Q0VE29 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Samd12Q0VE29 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Samd12Q0VE29 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Samd12Q0VE29 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Samd12Q0VE29 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Samd12Q0VE29 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Samd12Q0VE29 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Samd12Q0VE29 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Samd12Q0VE29 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Samd12Q0VE29 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Samd12Q0VE29 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Samd12Q0VE29 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Samd12Q0VE29 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Samd12Q0VE29 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Samd12Q0VE29 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Samd12Q0VE29 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samd12Q0VE29 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Samd12Q0VE29 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samd12Q0VE29 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Samd12Q0VE29 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Samd12Q0VE29 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Samd12Q0VE29 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Samd12Q0VE29 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Samd12Q0VE29 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Samd12Q0VE29 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Samd12Q0VE29 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Samd12Q0VE29 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Samd12Q0VE29 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Samd12Q0VE29 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Samd12Q0VE29 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Samd12Q0VE29 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Samd12Q0VE29 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Samd12Q0VE29 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Samd12Q0VE29 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Samd12Q0VE29 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Samd12Q0VE29 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Samd12Q0VE29 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Samd12Q0VE29 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Samd12Q0VE29 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Samd12Q0VE29 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Samd12Q0VE29 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Samd12Q0VE29 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Samd12Q0VE29 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Samd12Q0VE29 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Samd12Q0VE29 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Samd12Q0VE29 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Samd12Q0VE29 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Samd12Q0VE29 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Samd12Q0VE29 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Samd12Q0VE29 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Samd12Q0VE29 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Samd12Q0VE29 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Samd12Q0VE29 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Samd12Q0VE29 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Samd12Q0VE29 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Samd12Q0VE29 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Samd12Q0VE29 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Samd12Q0VE29 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd12Q0VE29 Trp53i13-201ENSMUST00000060417 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd12Q0VE29 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Samd12Q0VE29 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samd12Q0VE29 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samd12Q0VE29 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Samd12Q0VE29 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samd12Q0VE29 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Samd12Q0VE29 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Samd12Q0VE29 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samd12Q0VE29 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Samd12Q0VE29 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd12Q0VE29 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd12Q0VE29 Nrgn-201ENSMUST00000065668 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd12Q0VE29 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Samd12Q0VE29 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Samd12Q0VE29 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Samd12Q0VE29 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Samd12Q0VE29 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Samd12Q0VE29 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Samd12Q0VE29 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Samd12Q0VE29 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samd12Q0VE29 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samd12Q0VE29 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Samd12Q0VE29 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Samd12Q0VE29 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Samd12Q0VE29 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Samd12Q0VE29 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Samd12Q0VE29 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Samd12Q0VE29 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samd12Q0VE29 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samd12Q0VE29 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samd12Q0VE29 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samd12Q0VE29 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samd12Q0VE29 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samd12Q0VE29 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samd12Q0VE29 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Samd12Q0VE29 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms