Protein–RNA interactions for Protein: Q0P523

Cib3, Calcium and integrin-binding family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cib3Q0P523 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cib3Q0P523 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
Cib3Q0P523 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
Cib3Q0P523 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cib3Q0P523 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
Cib3Q0P523 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
Cib3Q0P523 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
Cib3Q0P523 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cib3Q0P523 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.57■□□□□ 0.72
Cib3Q0P523 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Cib3Q0P523 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cib3Q0P523 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cib3Q0P523 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Cib3Q0P523 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Cib3Q0P523 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cib3Q0P523 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cib3Q0P523 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Cib3Q0P523 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Cib3Q0P523 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Cib3Q0P523 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cib3Q0P523 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Cib3Q0P523 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Cib3Q0P523 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cib3Q0P523 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Cib3Q0P523 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Cib3Q0P523 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cib3Q0P523 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cib3Q0P523 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cib3Q0P523 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Cib3Q0P523 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cib3Q0P523 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cib3Q0P523 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Cib3Q0P523 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Cib3Q0P523 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Cib3Q0P523 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Cib3Q0P523 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cib3Q0P523 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cib3Q0P523 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cib3Q0P523 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Cib3Q0P523 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cib3Q0P523 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cib3Q0P523 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Cib3Q0P523 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cib3Q0P523 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cib3Q0P523 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Cib3Q0P523 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Cib3Q0P523 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Cib3Q0P523 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cib3Q0P523 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Cib3Q0P523 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Cib3Q0P523 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Cib3Q0P523 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cib3Q0P523 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cib3Q0P523 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Cib3Q0P523 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Cib3Q0P523 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cib3Q0P523 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Cib3Q0P523 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cib3Q0P523 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cib3Q0P523 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Cib3Q0P523 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Cib3Q0P523 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Cib3Q0P523 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cib3Q0P523 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Cib3Q0P523 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cib3Q0P523 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
Cib3Q0P523 Cd63-201ENSMUST00000026407 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Cib3Q0P523 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Cib3Q0P523 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cib3Q0P523 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cib3Q0P523 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Cib3Q0P523 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cib3Q0P523 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Cib3Q0P523 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cib3Q0P523 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cib3Q0P523 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cib3Q0P523 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Cib3Q0P523 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cib3Q0P523 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Cib3Q0P523 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cib3Q0P523 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cib3Q0P523 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Cib3Q0P523 Gm24109-201ENSMUST00000175489 103 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Cib3Q0P523 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cib3Q0P523 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Cib3Q0P523 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cib3Q0P523 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Cib3Q0P523 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cib3Q0P523 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cib3Q0P523 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Cib3Q0P523 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cib3Q0P523 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cib3Q0P523 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Cib3Q0P523 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cib3Q0P523 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cib3Q0P523 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cib3Q0P523 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cib3Q0P523 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cib3Q0P523 AC153911.1-202ENSMUST00000218534 1034 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cib3Q0P523 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.6 ms