Protein–RNA interactions for Protein: Q08EC4

Cass4, Cas scaffolding protein family member 4, mousemouse

Predictions only

Length 804 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cass4Q08EC4 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cass4Q08EC4 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Cass4Q08EC4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cass4Q08EC4 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Cass4Q08EC4 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Cass4Q08EC4 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cass4Q08EC4 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Cass4Q08EC4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Cass4Q08EC4 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Cass4Q08EC4 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cass4Q08EC4 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Cass4Q08EC4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Cass4Q08EC4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Cass4Q08EC4 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Cass4Q08EC4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Cass4Q08EC4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cass4Q08EC4 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cass4Q08EC4 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Cass4Q08EC4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Cass4Q08EC4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cass4Q08EC4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cass4Q08EC4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Cass4Q08EC4 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Cass4Q08EC4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Cass4Q08EC4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cass4Q08EC4 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cass4Q08EC4 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cass4Q08EC4 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Cass4Q08EC4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Cass4Q08EC4 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cass4Q08EC4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Cass4Q08EC4 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Cass4Q08EC4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Cass4Q08EC4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cass4Q08EC4 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Cass4Q08EC4 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Cass4Q08EC4 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cass4Q08EC4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Cass4Q08EC4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cass4Q08EC4 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Cass4Q08EC4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Cass4Q08EC4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Cass4Q08EC4 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Cass4Q08EC4 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Cass4Q08EC4 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Cass4Q08EC4 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cass4Q08EC4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cass4Q08EC4 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Cass4Q08EC4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cass4Q08EC4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Cass4Q08EC4 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Cass4Q08EC4 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
Cass4Q08EC4 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Cass4Q08EC4 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cass4Q08EC4 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Cass4Q08EC4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cass4Q08EC4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Cass4Q08EC4 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Cass4Q08EC4 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cass4Q08EC4 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cass4Q08EC4 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Cass4Q08EC4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Cass4Q08EC4 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Cass4Q08EC4 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cass4Q08EC4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Cass4Q08EC4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Cass4Q08EC4 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Cass4Q08EC4 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Cass4Q08EC4 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Cass4Q08EC4 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Cass4Q08EC4 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cass4Q08EC4 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Cass4Q08EC4 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Cass4Q08EC4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cass4Q08EC4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cass4Q08EC4 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Cass4Q08EC4 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Cass4Q08EC4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Cass4Q08EC4 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Cass4Q08EC4 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Cass4Q08EC4 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cass4Q08EC4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Cass4Q08EC4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cass4Q08EC4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cass4Q08EC4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cass4Q08EC4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Cass4Q08EC4 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cass4Q08EC4 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Cass4Q08EC4 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Cass4Q08EC4 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Cass4Q08EC4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cass4Q08EC4 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Cass4Q08EC4 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Cass4Q08EC4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cass4Q08EC4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Cass4Q08EC4 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cass4Q08EC4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cass4Q08EC4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Cass4Q08EC4 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Cass4Q08EC4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms