Protein–RNA interactions for Protein: Q08369

Gata4, Transcription factor GATA-4, mousemouse

Predictions only

Length 441 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gata4Q08369 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gata4Q08369 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Gata4Q08369 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gata4Q08369 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gata4Q08369 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gata4Q08369 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gata4Q08369 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Gata4Q08369 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Gata4Q08369 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Gata4Q08369 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.14■□□□□ 0.97
Gata4Q08369 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Gata4Q08369 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gata4Q08369 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Gata4Q08369 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Gata4Q08369 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gata4Q08369 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Gata4Q08369 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Gata4Q08369 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Gata4Q08369 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Gata4Q08369 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gata4Q08369 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gata4Q08369 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Gata4Q08369 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gata4Q08369 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Gata4Q08369 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Gata4Q08369 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Gata4Q08369 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Gata4Q08369 Hoxd8-201ENSMUST00000019749 2634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gata4Q08369 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Gata4Q08369 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Gata4Q08369 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Gata4Q08369 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gata4Q08369 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Gata4Q08369 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Gata4Q08369 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Gata4Q08369 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Gata4Q08369 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gata4Q08369 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gata4Q08369 Zxdb-201ENSMUST00000101388 5619 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Gata4Q08369 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Gata4Q08369 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Gata4Q08369 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Gata4Q08369 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Gata4Q08369 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gata4Q08369 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gata4Q08369 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Gata4Q08369 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gata4Q08369 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Gata4Q08369 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Gata4Q08369 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gata4Q08369 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gata4Q08369 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Gata4Q08369 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gata4Q08369 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gata4Q08369 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Gata4Q08369 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Gata4Q08369 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Gata4Q08369 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Gata4Q08369 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gata4Q08369 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Gata4Q08369 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Gata4Q08369 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.91
Gata4Q08369 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Gata4Q08369 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Gata4Q08369 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gata4Q08369 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Gata4Q08369 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gata4Q08369 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Gata4Q08369 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gata4Q08369 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Gata4Q08369 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Gata4Q08369 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Gata4Q08369 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gata4Q08369 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Gata4Q08369 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Gata4Q08369 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Gata4Q08369 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Gata4Q08369 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gata4Q08369 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gata4Q08369 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gata4Q08369 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Gata4Q08369 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gata4Q08369 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gata4Q08369 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.58■□□□□ 0.88
Gata4Q08369 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gata4Q08369 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
Gata4Q08369 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gata4Q08369 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gata4Q08369 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gata4Q08369 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gata4Q08369 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gata4Q08369 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gata4Q08369 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gata4Q08369 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gata4Q08369 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gata4Q08369 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gata4Q08369 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gata4Q08369 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gata4Q08369 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gata4Q08369 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms