Protein–RNA interactions for Protein: Q07563

Col17a1, Collagen alpha-1(XVII) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col17a1Q07563 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC43.97■■■■■ 4.63
Col17a1Q07563 Peli2-204ENSMUST00000226513 1320 ntBASIC43.96■■■■■ 4.63
Col17a1Q07563 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.89■■■■■ 4.62
Col17a1Q07563 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC43.88■■■■■ 4.61
Col17a1Q07563 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC43.85■■■■■ 4.61
Col17a1Q07563 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
Col17a1Q07563 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC43.83■■■■■ 4.61
Col17a1Q07563 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC43.82■■■■■ 4.61
Col17a1Q07563 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
Col17a1Q07563 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC43.79■■■■■ 4.6
Col17a1Q07563 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC43.76■■■■■ 4.6
Col17a1Q07563 Cyhr1-203ENSMUST00000176274 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.74■■■■■ 4.59
Col17a1Q07563 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC43.67■■■■■ 4.58
Col17a1Q07563 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC43.66■■■■■ 4.58
Col17a1Q07563 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.64■■■■■ 4.58
Col17a1Q07563 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC43.58■■■■■ 4.57
Col17a1Q07563 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC43.56■■■■■ 4.56
Col17a1Q07563 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC43.52■■■■■ 4.56
Col17a1Q07563 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC43.52■■■■■ 4.56
Col17a1Q07563 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC43.51■■■■■ 4.56
Col17a1Q07563 Nfic-204ENSMUST00000117966 1655 ntTSL 1 (best) BASIC43.47■■■■■ 4.55
Col17a1Q07563 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.46■■■■■ 4.55
Col17a1Q07563 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
Col17a1Q07563 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC43.4■■■■■ 4.54
Col17a1Q07563 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC43.38■■■■■ 4.53
Col17a1Q07563 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.35■■■■■ 4.53
Col17a1Q07563 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
Col17a1Q07563 Chmp4b-201ENSMUST00000044277 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
Col17a1Q07563 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
Col17a1Q07563 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC43.3■■■■■ 4.52
Col17a1Q07563 Fkbp8-204ENSMUST00000119698 1799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
Col17a1Q07563 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC43.27■■■■■ 4.52
Col17a1Q07563 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC43.26■■■■■ 4.52
Col17a1Q07563 Hoxa4-201ENSMUST00000101395 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
Col17a1Q07563 Psd-208ENSMUST00000224556 2034 ntBASIC43.25■■■■■ 4.51
Col17a1Q07563 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC43.23■■■■■ 4.51
Col17a1Q07563 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
Col17a1Q07563 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
Col17a1Q07563 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC43.13■■■■■ 4.49
Col17a1Q07563 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
Col17a1Q07563 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC43.03■■■■■ 4.48
Col17a1Q07563 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC43■■■■■ 4.47
Col17a1Q07563 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.98■■■■■ 4.47
Col17a1Q07563 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.96■■■■■ 4.47
Col17a1Q07563 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.96■■■■■ 4.47
Col17a1Q07563 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC42.95■■■■■ 4.47
Col17a1Q07563 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC42.91■■■■■ 4.46
Col17a1Q07563 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC42.87■■■■■ 4.45
Col17a1Q07563 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC42.86■■■■■ 4.45
Col17a1Q07563 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC42.82■■■■■ 4.45
Col17a1Q07563 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC42.81■■■■■ 4.44
Col17a1Q07563 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC42.78■■■■■ 4.44
Col17a1Q07563 Gm42596-201ENSMUST00000196305 1958 ntBASIC42.75■■■■■ 4.43
Col17a1Q07563 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC42.72■■■■■ 4.43
Col17a1Q07563 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC42.71■■■■■ 4.43
Col17a1Q07563 Carnmt1-201ENSMUST00000025632 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.67■■■■■ 4.42
Col17a1Q07563 Gm10524-201ENSMUST00000181931 1893 ntBASIC42.62■■■■■ 4.41
Col17a1Q07563 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC42.62■■■■■ 4.41
Col17a1Q07563 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC42.59■■■■■ 4.41
Col17a1Q07563 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC42.59■■■■■ 4.41
Col17a1Q07563 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.58■■■■■ 4.41
Col17a1Q07563 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.57■■■■■ 4.41
Col17a1Q07563 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC42.57■■■■■ 4.41
Col17a1Q07563 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC42.57■■■■■ 4.41
Col17a1Q07563 Abhd17a-204ENSMUST00000191440 1529 ntTSL 1 (best) BASIC42.54■■■■■ 4.4
Col17a1Q07563 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC42.53■■■■■ 4.4
Col17a1Q07563 Gm42517-201ENSMUST00000197216 1850 ntAPPRIS P1 BASIC42.52■■■■■ 4.4
Col17a1Q07563 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC42.51■■■■■ 4.4
Col17a1Q07563 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC42.49■■■■■ 4.39
Col17a1Q07563 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
Col17a1Q07563 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC42.49■■■■■ 4.39
Col17a1Q07563 Sh3glb2-201ENSMUST00000028214 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.47■■■■■ 4.39
Col17a1Q07563 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC42.47■■■■■ 4.39
Col17a1Q07563 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.46■■■■■ 4.39
Col17a1Q07563 Six2-201ENSMUST00000024947 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
Col17a1Q07563 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC42.41■■■■■ 4.38
Col17a1Q07563 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC42.39■■■■■ 4.38
Col17a1Q07563 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.37■■■■■ 4.37
Col17a1Q07563 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC42.37■■■■■ 4.37
Col17a1Q07563 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC42.37■■■■■ 4.37
Col17a1Q07563 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC42.36■■■■■ 4.37
Col17a1Q07563 CT025624.2-201ENSMUST00000223609 1909 ntBASIC42.36■■■■■ 4.37
Col17a1Q07563 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC42.36■■■■■ 4.37
Col17a1Q07563 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC42.34■■■■■ 4.37
Col17a1Q07563 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC42.34■■■■■ 4.37
Col17a1Q07563 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.31■■■■■ 4.36
Col17a1Q07563 Tmem165-201ENSMUST00000031144 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
Col17a1Q07563 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.3■■■■■ 4.36
Col17a1Q07563 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.28■■■■■ 4.36
Col17a1Q07563 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
Col17a1Q07563 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
Col17a1Q07563 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC42.25■■■■■ 4.35
Col17a1Q07563 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
Col17a1Q07563 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC42.24■■■■■ 4.35
Col17a1Q07563 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC42.2■■■■■ 4.35
Col17a1Q07563 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC42.18■■■■■ 4.34
Col17a1Q07563 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC42.17■■■■■ 4.34
Col17a1Q07563 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC42.16■■■■■ 4.34
Col17a1Q07563 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC42.14■■■■■ 4.34
Col17a1Q07563 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC42.13■■■■■ 4.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms