Protein–RNA interactions for Protein: Q07475

Nrep, Neuronal regeneration-related protein, mousemouse

Predictions only

Length 68 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NrepQ07475 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
NrepQ07475 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
NrepQ07475 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
NrepQ07475 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
NrepQ07475 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
NrepQ07475 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NrepQ07475 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
NrepQ07475 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NrepQ07475 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NrepQ07475 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
NrepQ07475 Ctdnep1-201ENSMUST00000108593 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
NrepQ07475 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
NrepQ07475 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NrepQ07475 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
NrepQ07475 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NrepQ07475 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
NrepQ07475 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NrepQ07475 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NrepQ07475 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
NrepQ07475 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NrepQ07475 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
NrepQ07475 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NrepQ07475 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
NrepQ07475 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
NrepQ07475 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
NrepQ07475 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
NrepQ07475 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
NrepQ07475 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
NrepQ07475 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
NrepQ07475 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
NrepQ07475 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC17.88■□□□□ 0.45
NrepQ07475 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NrepQ07475 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NrepQ07475 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NrepQ07475 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NrepQ07475 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
NrepQ07475 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
NrepQ07475 Gm15042-201ENSMUST00000120212 883 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
NrepQ07475 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
NrepQ07475 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
NrepQ07475 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NrepQ07475 Emx1-201ENSMUST00000045942 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NrepQ07475 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
NrepQ07475 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NrepQ07475 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
NrepQ07475 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NrepQ07475 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
NrepQ07475 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
NrepQ07475 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
NrepQ07475 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NrepQ07475 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
NrepQ07475 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NrepQ07475 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NrepQ07475 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
NrepQ07475 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
NrepQ07475 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
NrepQ07475 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
NrepQ07475 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NrepQ07475 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
NrepQ07475 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NrepQ07475 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NrepQ07475 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NrepQ07475 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
NrepQ07475 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
NrepQ07475 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NrepQ07475 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
NrepQ07475 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
NrepQ07475 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
NrepQ07475 Egln2-201ENSMUST00000080058 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NrepQ07475 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NrepQ07475 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NrepQ07475 Noxo1-201ENSMUST00000019464 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
NrepQ07475 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NrepQ07475 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
NrepQ07475 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NrepQ07475 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
NrepQ07475 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NrepQ07475 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
NrepQ07475 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NrepQ07475 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.68■□□□□ 0.42
NrepQ07475 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NrepQ07475 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
NrepQ07475 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NrepQ07475 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NrepQ07475 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NrepQ07475 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
NrepQ07475 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
NrepQ07475 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.64■□□□□ 0.41
NrepQ07475 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NrepQ07475 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.63■□□□□ 0.41
NrepQ07475 Gm15045-201ENSMUST00000117359 883 ntBASIC17.62■□□□□ 0.41
NrepQ07475 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NrepQ07475 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.62■□□□□ 0.41
NrepQ07475 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NrepQ07475 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
NrepQ07475 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NrepQ07475 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
NrepQ07475 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
NrepQ07475 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
NrepQ07475 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms