Protein–RNA interactions for Protein: Q07104

Gdf3, Growth/differentiation factor 3, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdf3Q07104 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gdf3Q07104 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Gdf3Q07104 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gdf3Q07104 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Gdf3Q07104 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Gdf3Q07104 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gdf3Q07104 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Gdf3Q07104 9230104M06Rik-201ENSMUST00000180971 1963 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Gdf3Q07104 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gdf3Q07104 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gdf3Q07104 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gdf3Q07104 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gdf3Q07104 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gdf3Q07104 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gdf3Q07104 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Gdf3Q07104 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Gdf3Q07104 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Gdf3Q07104 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Gdf3Q07104 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gdf3Q07104 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Gdf3Q07104 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Gdf3Q07104 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gdf3Q07104 Nt5dc2-204ENSMUST00000227096 1848 ntAPPRIS P5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Gdf3Q07104 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gdf3Q07104 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Gdf3Q07104 Nemp1-202ENSMUST00000118612 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Gdf3Q07104 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Gdf3Q07104 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gdf3Q07104 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Gdf3Q07104 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gdf3Q07104 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gdf3Q07104 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gdf3Q07104 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Gdf3Q07104 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Gdf3Q07104 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Gdf3Q07104 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gdf3Q07104 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Gdf3Q07104 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gdf3Q07104 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gdf3Q07104 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Gdf3Q07104 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Gdf3Q07104 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Gdf3Q07104 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
Gdf3Q07104 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gdf3Q07104 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Gdf3Q07104 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gdf3Q07104 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gdf3Q07104 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gdf3Q07104 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gdf3Q07104 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gdf3Q07104 Lactb-202ENSMUST00000215172 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gdf3Q07104 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gdf3Q07104 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gdf3Q07104 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gdf3Q07104 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gdf3Q07104 Stard10-201ENSMUST00000032927 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gdf3Q07104 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gdf3Q07104 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gdf3Q07104 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gdf3Q07104 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gdf3Q07104 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gdf3Q07104 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gdf3Q07104 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gdf3Q07104 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gdf3Q07104 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Gdf3Q07104 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gdf3Q07104 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Gdf3Q07104 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Gdf3Q07104 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gdf3Q07104 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Gdf3Q07104 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Gdf3Q07104 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gdf3Q07104 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gdf3Q07104 Gm20732-201ENSMUST00000175699 686 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gdf3Q07104 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Gdf3Q07104 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gdf3Q07104 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gdf3Q07104 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Gdf3Q07104 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Gdf3Q07104 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Gdf3Q07104 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Gdf3Q07104 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gdf3Q07104 Gnai2-202ENSMUST00000192615 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Gdf3Q07104 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Gdf3Q07104 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gdf3Q07104 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gdf3Q07104 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Gdf3Q07104 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gdf3Q07104 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Gdf3Q07104 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Gdf3Q07104 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Gdf3Q07104 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Gdf3Q07104 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gdf3Q07104 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Gdf3Q07104 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Gdf3Q07104 Zfp131-207ENSMUST00000224946 1783 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Gdf3Q07104 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Gdf3Q07104 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gdf3Q07104 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Gdf3Q07104 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms