Protein–RNA interactions for Protein: Q05020

Apoc2, Apolipoprotein C-II, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apoc2Q05020 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Apoc2Q05020 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Apoc2Q05020 Lactb-201ENSMUST00000034929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Apoc2Q05020 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Apoc2Q05020 Ric1-206ENSMUST00000162184 2157 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apoc2Q05020 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apoc2Q05020 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Apoc2Q05020 Ube2q2-202ENSMUST00000121677 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Apoc2Q05020 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Apoc2Q05020 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Apoc2Q05020 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Apoc2Q05020 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apoc2Q05020 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Apoc2Q05020 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apoc2Q05020 Gm45716-202ENSMUST00000134929 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Apoc2Q05020 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apoc2Q05020 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Apoc2Q05020 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Apoc2Q05020 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Apoc2Q05020 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apoc2Q05020 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Apoc2Q05020 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apoc2Q05020 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apoc2Q05020 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Apoc2Q05020 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apoc2Q05020 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apoc2Q05020 Glrx5-203ENSMUST00000223244 793 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apoc2Q05020 Ebag9-203ENSMUST00000227691 1945 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apoc2Q05020 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Apoc2Q05020 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Apoc2Q05020 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Apoc2Q05020 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Apoc2Q05020 Fcho2-203ENSMUST00000109403 1523 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Apoc2Q05020 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Apoc2Q05020 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apoc2Q05020 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apoc2Q05020 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Apoc2Q05020 Smad7-202ENSMUST00000168918 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Apoc2Q05020 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Apoc2Q05020 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Apoc2Q05020 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apoc2Q05020 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apoc2Q05020 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Apoc2Q05020 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Apoc2Q05020 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apoc2Q05020 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Apoc2Q05020 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Apoc2Q05020 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apoc2Q05020 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apoc2Q05020 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Apoc2Q05020 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apoc2Q05020 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apoc2Q05020 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apoc2Q05020 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Apoc2Q05020 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apoc2Q05020 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Apoc2Q05020 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apoc2Q05020 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Apoc2Q05020 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apoc2Q05020 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apoc2Q05020 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apoc2Q05020 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apoc2Q05020 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Apoc2Q05020 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Apoc2Q05020 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apoc2Q05020 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Apoc2Q05020 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apoc2Q05020 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Apoc2Q05020 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Apoc2Q05020 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apoc2Q05020 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Apoc2Q05020 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Apoc2Q05020 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apoc2Q05020 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Apoc2Q05020 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Apoc2Q05020 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Apoc2Q05020 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Apoc2Q05020 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Apoc2Q05020 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
Apoc2Q05020 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Apoc2Q05020 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Apoc2Q05020 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Apoc2Q05020 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apoc2Q05020 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apoc2Q05020 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Apoc2Q05020 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Apoc2Q05020 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Apoc2Q05020 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apoc2Q05020 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Apoc2Q05020 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Apoc2Q05020 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apoc2Q05020 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Apoc2Q05020 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apoc2Q05020 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apoc2Q05020 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Apoc2Q05020 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apoc2Q05020 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Apoc2Q05020 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Apoc2Q05020 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Apoc2Q05020 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms